Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15990
• Subject: XM_017025095.1
• Aligned Length: 974
• Identities: 775
• Gaps: 199

Alignment

Query   1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query  75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query 149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query 223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query 297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query 371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query 445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCC-------------------  499
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGCTTCCCTCTGGGCAGT  518

Query 500  -------------------CAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  554
                              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AACTCTACCAACCCCTCCACAGAGTCCCATTCACCCAGGGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGA  592

Query 555  GCAGCTGGAGCCTGAGCT---------------------GGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  607
           ||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GCAGCTGGAGCCTGAGCTGCTCTCTGACTCATCTCAGCAGGTTTGGACAGAGCAGCGGGCAGCATCTGGAGGAA  666

Query 608  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGCCCGCCGGGGCCCCAG  681
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 667  AGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAA----------------------------------  706

Query 682  GAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGTGCAGGCGAGGGTGCA  755
                                                                                     
Sbjct 707  --------------------------------------------------------------------------  706

Query 756  GAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  829
                                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707  --------------------------------AGAGGCCGCAGCCCAGGCCCAGTGCTCGGCCATGGCCCCTTG  748

Query 830  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  903
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749  GGCTCCCGGGGCCCGCGCTGCTCTTCTTCCTCCTGTGGCCCTTCGTCGTCCAGTGGCTCTTCCGAATGTTTCGG  822

Query 904  ACCCAAAAGAGG  915
           ||||||||||||
Sbjct 823  ACCCAAAAGAGG  834