Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_16043
- Subject:
- NM_006001.3
- Aligned Length:
- 1352
- Identities:
- 1132
- Gaps:
- 7
Alignment
Query 1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG 74
|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA 148
|||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 75 CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 ACACCTTCTTCAGTGAAACGGGTGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC 222
||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACTTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTCATCACAGGCAAGGAAGATGC 296
.|.||||||||.|||||.||.||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC 296
Query 297 TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA 370
.||||||||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 297 GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA 370
Query 371 AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG 444
|.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG 444
Query 445 TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC 518
|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..||||||||||
Sbjct 445 TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC 518
Query 519 GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT 592
.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT 592
Query 593 CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA 666
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct 593 CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC 666
Query 667 ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC 740
||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||
Sbjct 667 ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC 740
Query 741 CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT 814
|||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT 814
Query 815 ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTACTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT 888
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC 888
Query 889 GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTATACCGTGG 962
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||.|||.|.||
Sbjct 889 GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG 962
Query 963 TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT 1036
.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT 1036
Query 1037 GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATTAATTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGCGGAGACCTGGCCAAG 1110
|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG 1110
Query 1111 GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAATACCACAGCTGTTGCCGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT 1184
||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT 1184
Query 1185 TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG 1258
.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG 1258
Query 1259 AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGAGCAGAT--AGTGCTGACGGAGAG- 1329
|||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|..||| .||| ||.|..|||
Sbjct 1259 AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTG--GAAGCCGAGG 1330
Query 1330 --GATGAGGGTGAAGAGTAT 1347
||.||.||||||||.||.
Sbjct 1331 CTGAAGAAGGTGAAGAATAC 1350