Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16061
• Subject: XR_428863.3
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1086
• Gaps: 394

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGACATTGGTCTCATGTCCTAGGAAGAAGCGTGGATGGTCTTGCCCTGGCTCATCTGCTCAGTTTCCCCACT  74

Query    1  -------ATGCCTGGATGTCCCTGCCCTGGCTGTGGCATGGCGGGCCCAAGGCTCCTCTTCCTCACTGCCCTTG  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGTGGCATGCCTGGATGTCCCTGCCCTGGCTGTGGCATGGCGGGCCCAAGGCTCCTCTTCCTCACTGCCCTTG  148

Query   68  CCCTGGAGCTCTTGGGAAGGGCTGGGGGTTCCCAGCCGGCCCTCCGGAGCCGGGGGACTGCGACGGCCTGTCGC  141
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGAGCTCTTGGAAAGGGCTGGGGGTTCCCAGCCGGCCCTCCGGAGCCGGGGGACTGCGACGGCCTGTCGC  222

Query  142  CTGGACAACAAGGAAAGCGAGTCCTGGGGGGCTCTGCTGAGCGGAGAGCGGCTGGACACCTGGATCTGCTCCCT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGACAACAAGGAAAGCGAGTCCTGGGGGGCTCTGCTGAGCGGAGAGCGGCTGGACACCTGGATCTGCTCCCT  296

Query  216  CCTGGGTTCCCTCATGGTGGGGCTCAGTGGGGTCTTCCCGTTGCTTGTCATTCCCCTAGAGATGGGGACCATGC  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGGTTCCCTCATGGTGGGGCTCAGTGGGGTCTTCCCGTTGCTTGTCATTCCCCTAGAGATGGGGACCATGC  370

Query  290  TGCGCTCAGAAGCTGGGGCCTGGCGCCTGAAGCAGCTGCTCAGCTTCGCCCTGGGGGGACTCTTGGGCAATGTG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCGCTCAGAAGCTGGGGCCTGGCGCCTGAAGCAGCTGCTCAGCTTCGCCCTGGGGGGACTCTTGGGCAATGTG  444

Query  364  TTTCTGCATCTGCTGCCCGAAGCCTGGGCCTACACGTGCAGCGCCAGCCCTGGTGGTGAGGGGCAGAGCCTGCA  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCTGCATCTGCTGCCCGAAGCCTGGGCCTACACGTGCAGCGCCAGCCCTGGTGGTGAGGGGCAGAGCCTGCA  518

Query  438  GCAGCAGCAACAGCTGGGGCTGTGGGTCATTGCTGGCATCCTGACCTTCCTGGCGTTGGAGAAGATGTTCCTGG  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCAGCAACAGCTGGGGCTGTGGGTCATTGCTGGCATCCTGACCTTCCTGGCGTTGGAGAAGATGTTCCTGG  592

Query  512  ACAGCAAGGAGGAGGGGACCAGCCAGGCCCCCAACAAAGACCCCACTGCTGCTGCCGCCGCACTCAATGGAGGC  585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  ACAGCAAGGAGGAGGGGACCAGCCAGGCCCCCAACAAAGACCCCACTGCTGCTGCCGCCGCGCTCAATGGAGGC  666

Query  586  CACTGTCTGGCCCAGCCGGCTGCAGAGCCCGGCCTCGGTGCCGTGGTCCGGAGCATCAAAGTCAGCGGCTACCT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACTGTCTGGCCCAGCCGGCTGCAGAGCCCGGCCTCGGTGCCGTGGTCCGGAGCATCAAAGTCAGCGGCTACCT  740

Query  660  CAACCTGCTGGCCAACACCATCGATAACTTCACCCACGGGCTGGCTGTGGCTGCCAGCTTCCTTGTGAGCAAGA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACCTGCTGGCCAACACCATCGATAACTTCACCCACGGGCTGGCTGTGGCTGCCAGCTTCCTTGTGAGCAAGA  814

Query  734  AGATCGGGCTCCTGACAACCATGGCCATCCTCCTGCATGAGATCCCCCATGAGGTGGGCGACTTTGCCATCCTG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATCGGGCTCCTGACAACCATGGCCATCCTCCTGCATGAGATCCCCCATGAGGTGGGCGACTTTGCCATCCTG  888

Query  808  CTCCGGGCCGGCTTTGACCGATGGAGCGCAGCCAAGCTGCAACTCTCAACAGCGCTGGGGGGCCTACTGGGCGC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCGGGCCGGCTTTGACCGATGGAGCGCAGCCAAGCTGCAACTCTCAACAGCGCTGGGGGGCCTACTGGGCGC  962

Query  882  TGGCTTCGCCATCTGTACCCAGTCCCCCAAGGGAGTAGAGGAGACGGCAGCCTGGGTCCTGCCCTTCACCTCTG  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGCTTCGCCATCTGTACCCAGTCCCCCAAGGGA----AGGAGACGGCAGCCTGGGTCCTGCCCTTCACCTCTG  1032

Query  956  GCGGCTTTCTCTACATCGCCTTGGTGAACGTGCTCCCTGACCTCTTGGAAGAAGAGGACCCGTGGCGCTCCCTG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GCGGCTTTCTCTACATCGCCTTGGTGAACGTGCTCCCTGACCTCTTGGAAGAAGAGGACCCGTGGCGCTCCCTG  1106

Query 1030  CAGCAGCTGCTTCTGCTCTGTGCGGGCATCGTGGTAATGGTGCTGTTCTCGCTCTTCGTGGAT-----------  1092
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1107  CAGCAGCTGCTTCTGCTCTGTGCGGGCATCGTGGTAATGGTGCTGTTCTCGCTCTTCGTGGATTAACTTTCCCT  1180

Query 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092
                                                                                      
Sbjct 1181  GATGCCGACGCCCCTGCCCCCTGCAGCAATAAGATGCTCGGATTCACTCTGTGACCGCATATGTGAGAGGCAGA  1254

Query 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092
                                                                                      
Sbjct 1255  GAGGGCGAGTGGCTGCGAGAGAGAATGAGCCTCCCGCCAGACAGGAGGGAGGTACTCAGCTGGCCCACTCCACA  1328

Query 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092
                                                                                      
Sbjct 1329  GCCAGGCCTGGCCCTGCCCTTCACCGTGGATGTTTTCAGAAGTGGCCATCGAGAGGTCTGGATGGTTTTATAGC  1402

Query 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092
                                                                                      
Sbjct 1403  AACTTTGCTGTGATTCCGTTTGTATCTGTAAATATTTGTTCTATAGATAAGATACAAATAAATATTATCCACAT  1476

Query 1093  --  1092
              
Sbjct 1477  AC  1478