Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16069
• Subject: NM_001166305.2
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1185
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGGCGCCCAGCCCCGCGCCCGCGCTCTGGGACTGGGACTACCTGGACCGCTGCTTCGCCCGCAACCG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGGCGCCCAGCCCCGCGCCCGCGCTCTGGGACTGGGACTACCTGGACCGCTGCTTCGCCCGCCACCG  74

Query   75  CGTCTGCATCTCCTTCGGCCTGTGGATCTGCGCCTCCTCCTGCTGGATCGCCGCCCACGCGCTGCTTCTCTATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTCTGCATCTCCTTCGGCCTGTGGATCTGCGCCTCCTCCTGCTGGATCGCCGCCCACGCGCTGCTTCTCTATC  148

Query  149  TGAGATGTGCACAGAAACCCAGACAGGACCAGTCGGCACTGTGTGCTGCATGCTGCCTCCTGACCAGTCTGTGT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGATGTGCACAGAAACCCAGACAGGACCAGTCGGCACTGTGTGCTGCGTGCTGCCTCCTGACCAGTCTGTGT  222

Query  223  GACACCGTCGGGGCTCTTCTGGCCAGACAGCTCACAATCCAGGTTTTCACTGGTGCCTACCTAGCAGCTATTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACACCGTCGGGGCTCTTCTGGCCAGACAGCTCACAATCCAGGTTTTCACTGGTGCCTACCTAGCAGCTATTGA  296

Query  297  CTTAGTGAACTTTATGTTCATTCTCTTCCCAGTCTGTGGATCCAAATTCAAGTCTAATTCAGATCGGGAAGCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTAGTGAACTTTATGTTCATTCTCTTCCCAGTCTGTGGATCCAAATTCAAGTCTAATTCAGATCGGGAAGCCC  370

Query  371  GAGAGAGGAAGAGGAGGCGGCAGCTCAGGGCCAGTGTGTTTGCCCTGGCCCTGCCGCTGAGCCTGGGCCCGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGAGAGGAAGAGGAGGCGGCAGCTCAGGGCCAGTGTGTTTGCCCTGGCCCTGCCGCTGAGCCTGGGCCCGTGC  444

Query  445  TGGGCTCTGTGGGTTGCTGTCCCGAAGGCTTCAGCCACCATCCGGGGGCCACAGCGGAGGCTGCTAGCGAGCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGGCTCTGTGGGTTGCTGTCCCGAAGGCTTCAGCCACCATCCGGGGGCCACAGCGGAGGCTGCTAGCGAGCCT  518

Query  519  GCTGCAGGAAAATACTGAGATCCTCGGCTACCTGCTGGGTAGCGTTGCTGCCTTTGGCTCCTGGGCTTCTCGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGCAGGAAAATACTGAGATCCTCGGCTACCTGCTGGGTAGCGTTGCTGCCTTTGGCTCCTGGGCTTCTCGGA  592

Query  593  TCCCCCCTCTCTCCAGAATT------------------------------------------------------  612
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  593  TCCCCCCTCTCTCCAGAATTGCCCCACCTCCGACACTGGGGATTACGACTCAACATGAGATCTGGCGGGGACAA  666

Query  613  --------------------------------------------------------------------------  612
                                                                                      
Sbjct  667  ATGTCCAAACCATCCCAGTCTCCCTCACGTTCTCCCAGCGGACATTGGCGAGCCGCTGCCCAGCGTCAGGTGCT  740

Query  613  -------------TGCCGGGGGAAGACATTTCCCTCCATCCACCTGTGGACCCGGCTCCTGTCGGCCCTGGCTG  673
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCACTGAGATGTGCCGGGGGAAGACATTTCCCTCCATCCACCTGTGGACCCGGCTCCTGTCGGCCCTGGCTG  814

Query  674  GCCTCCTCTATGCCTCGGCCATTGTGGCCCACGACCGGCACCCTGAGTACCTGCTGCGGGCCACACCCTGGTTC  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTCCTCTATGCCTCGGCCATTGTGGCCCACGACCAGCACCCTGAGTACCTGCTGCGGGCCACACCCTGGTTC  888

Query  748  CTGACCTCCCTCGGCCGTGCGGCACTGGACCTCGCTATTATTTTCCTTTCGTGTGTGATGAAGAGCAAGATGAG  821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGACCTCCCTCGGCCGTGCGGCACTGGACCTCGCTATTATTTTCCTTTCGTGTGTGATGAAGAGCAAGATGAG  962

Query  822  ACAGGCCTTAGGATTTGCCAAGGAAGCCAGAGAGAGCCCTGACACCCAAGCCCTTTTGACCTGTGCAGAGAAAG  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGGCCTTAGGATTTGCCAAGGAAGCCAGAGAGAGCCCTGACACCCAAGCCCTTTTGACCTGTGCAGAGAAAG  1036

Query  896  AGGAAGAAAACCAGGAGAATTTGGATTGGGTGCCTCTCACCACACTGTCACACTGCAAGTCACTGAGGACAATG  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGAAGAAAACCAGGAGAATTTGGATTGGGTGCCTCTCACCACACTGTCACACTGCAAGTCACTGAGGACAATG  1110

Query  970  ACAGCAATCAGTCGCTACATGGAGCTGACCATCGAGCCTGTGCA----GCAGGCTGCAGTGCCACCAGGCTGCC  1039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAGCAATCAGTCGCTACATGGAGCTGACCATCGAGCCTGTGCAGCAGGCAGGCTGCAGTGCCACCAGGCTGCC  1184

Query 1040  AGGTGACGGGCAGACGAGCGCCGGAGATGCGTCCCTGCAGGACCCCCCGTCGTACCCTCCCGTTCAGGTCATCC  1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGTGACGGGCAGACGAGCGCCGGAGATGCGTCCCTGCAGGACCCCCCGTCGTACCCTCCCGTTCAGGTCATCC  1258

Query 1114  GGGCCCGGGTGTCTTCCGGCAGCTCCTCTGAGGTCTCCTCCATCAACTCCGACCTGGAGTGGGACCCTGAAGAT  1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCCCGGGTGTCTTCCGGCAGCTCCTCTGAGGTCTCCTCCATCAACTCCGACCTGGAGTGGGACCCTGAAGAT  1332

Query 1188  G-------------------------------------------------------------------------  1188
            |                                                                         
Sbjct 1333  GTGAACCTCGAAGGCAGCAAAGAAAATGTGGAGCTACTGGGATCCCAGGTGCACCAGGACTCTGTGAGGACAGC  1406

Query 1189  -------------------  1188
                               
Sbjct 1407  ACACCTGAGTGATGATGAT  1425