Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16081
• Subject: XM_006513547.3
• Aligned Length: 873
• Identities: 663
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGGAATTGAAGTTAAAAGATGAAGAATGTGAGAGACTTTCGAAAGTGCGGGATCAACTTGGGCAGGAGTTGGA  74

Query   1  -------------------------------------ATGGTGAGAGAAGCAAATATCAAGCAGGCAACAGCAG  37
                                                ||||||||.|||||.||..|||||||.||.||.||||
Sbjct  75  AGAACTCACAGCTAGTTTGTTTGAGGAAGCTCACAAGATGGTGAGGGAAGCGAACGTCAAGCAAGCCACTGCAG  148

Query  38  AAAAACAGCTAAAAGAAGCACAAGGAAAAATTGATGTACTTCAAGCTGAAGTAGCTGCATTGAAGACACTTGTA  111
           |.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||.|||
Sbjct 149  AGAAGCAGCTGAAGGAAGCCCAGGGGAAAATTGATGTACTTCAGGCTGAAGTGGCCGCTCTGAAGACACTCGTA  222

Query 112  TTGTCCAGTTCTCCAACATCACCTACGCAGGAGCCTTTGCCAGGTGGAAAGACACCTTTTAAAAAGGGGCATAC  185
           .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|.|.||.||||||.||.|||||||.||||||.||
Sbjct 223  CTGTCCAGTTCTCCAACATCGCCTACGCAGGAGCCTCTGGCGGCTGCAAAGACCCCCTTTAAAAGGGGGCACAC  296

Query 186  AAGAAATAAAAGCACAAGCAGTGCTATGAGTGGCAGTCATCAGGACCTCAGTGTGATACAGCCAATTGTAAAAG  259
           |||.||.|||||.||||||||.||.|||.||||.||.||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 297  AAGGAACAAAAGTACAAGCAGCGCCATGGGTGGGAGCCACCAGGACTTGAGTGTGATCCAGCCAATCGTAAAAG  370

Query 260  ACTGCAAAGAGGCTGACTTATCCTTGTATAATGAATTCCGATTGTGGAAGGATGAGCCCACAATGGACAGGACG  333
           ||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||.|||..|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 371  ACTGCAAAGAGGCTGATTTATCGCTGTATAATGAGTTCAGATCTTGGAAGGATGAGCCCACGATGGACAGAACG  444

Query 334  TGTCCTTTCTTAGACAAAATCTACCAGGAAGATATCTTTCCATGTTTAACATTCTCAAAAAGTGAGTTGGCTTC  407
           |||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||
Sbjct 445  TGTCCTTTCCTGGACAAAATCTACCAGGAGGACATCTTTCCATGTTTAACATTTGCAAAGAGTGAGTTGGCTTC  518

Query 408  AGCTGTTCTGGAGGCTGTGGAAAACAATACTCTAAGCATTGAACCAGTGGGATTACAACCTATCCGGTTTGTGA  481
           |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 519  AGCTGTTCTGGAGGCTGTGGAGAACAACACTCTAAGCATCGAACCAGTGGGGTTGCAGCCCATCCGCTTCGTGA  592

Query 482  AAGCTTCTGCAGTTGAATGCGGAGGACCAAAAAAATGTGCTCTCACTGGCCAGAGTAAGTCCTGTAAACACAGA  555
           |.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.|..|||||.
Sbjct 593  AGGCTTCCGCTGTCGAGTGCGGAGGGCCAAAAAAGTGTGCGCTCACTGGCCAGAGTAAGCCCTGCAGGCACAGG  666

Query 556  ATTAAATTAGGGGACTCAAGCAACTATTATTATATTTCTCCTTTTTGCAGATACAGGATCACTTCTGTATGTAA  629
           ||||...|.||||||||.|||..||.|||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ATTAGGCTCGGGGACTCCAGCTGCTGTTACTACATCTCTCCTTTCTGCAGATACAGGATCACTTCTGTATGTAA  740

Query 630  CTTTTTTACATACATTCGATACATTCAGCAGGGACTCGTGAAACAGCAGGATGTTGATCAGATGTTTTGGGAGG  703
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 741  CTTTTTTACATACATTCGATACATTCAGCAGGGACTCGTGAAACAGCAGGATGTCGATCAGATGTTTTGGGAAG  814

Query 704  TTATGCAGTTGAGAAAAGAGATGTCATTGGCAAAGCTGGGTTATTTCAAAGAGGAACTC  762
           ||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 815  TTATGCAGTTGAGAAAGGAGATGTCGTTGGCAAAGCTGGGATATTTCAAAGAGGAACTC  873