Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16127
• Subject: XM_017015883.1
• Aligned Length: 1653
• Identities: 1526
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGGAACTTAAAAAGTCGCCTGACGGTGGATGGGGCTGGGTGATTGTGTTTGTCTCCTTCCTTACTCAGTTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAACTTAAAAAGTCGCCTGACGGTGGATGGGGCTGGGTGATTGTGTTTGTCTCCTTCCTTACTCAGTTTTT  74

Query   75  GTGTTACGGATCCCCACTAGCTGTTGGAGTCCTGTATATAGAATGGCTGGATGCCTTTGGTGAAGGAAAAGGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGTTACGGATCCCCACTAGCTGTTGGAGTCCTGTACATAGAATGGCTGGATGCCTTTGGTGAAGGAAAAGGAA  148

Query  149  AAACAGCCTGGGTTGGATCCCTGGCAAGTGGAGTTGGCTTGCTTGCAAGTCCTGTCTGCAGTCTCTGTGTCTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAACAGCCTGGGTTGGATCCCTGGCAAGTGGAGTTGGCTTGCTTGCAAGTCCTGTCTGCAGTCTCTGTGTCTCA  222

Query  223  TCTTTTGGAGCAAGACCTGTCACAATCTTCAGTGGCTTCATGGTGGCTGGAGGCCTGATGTTGAGCAGTTTTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTTTGGAGCAAGACCTGTCACAATCTTCAGTGGCTTCATGGTGGCTGGAGGCCTGATGTTGAGCAGTTTTGC  296

Query  297  TCCCAATATCTACTTTCTGTTTTTTTCCTATGGCATTGTTGTAGGTCTTGGATGTGGTTTATTATACACTGCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCCAATATCTACTTTCTGTTTTTTTCCTATGGCATTGTTGTAGGTCTTGGATGTGGTTTATTATACACTGCAA  370

Query  371  CAGTGACCATTACGTGCCAGTATTTTGACGATCGCCGAGGCCTAGCGCTTGGCCTGATTTCAACAGGTTCAAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTGACCATTACGTGCCAGTATTTTGACGATCGCCGAGGCCTAGCGCTTGGCCTGATTTCAACAGGTTCAAGC  444

Query  445  GTTGGCCTTTTCATATATGCTGCTCTGCAGAGGATGCTGGTTGAGTTCTATGGACTGGATGGATGCTTGCTGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGGCCTTTTCATATATGCTGCTCTGCAGAGGATGCTGGTTGAGTTCTATGGACTGGATGGATGCTTGCTGAT  518

Query  519  TGTGGGTGCTTTAGCTTTAAATATATTAGCCTGTGGCAGTCTGATGAGACCCCTCCAATCTTCTGATTGTCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGGTGCTTTAGCTTTAAATATATTAGCCTGTGGCAGTCTGATGAGACCCCTCCAATCTTCTGATTGTCCTT  592

Query  593  TGCCTAAAAAAATAGCTCCAGAAGATCTACCAGATAAATACTCCATTTACAATGAAAAAGGAAAGAATCTGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCCTAAAAAAATAGCTCCAGAAGATCTACCAGATAAATACTCCATTTACAATGAAAAAGGAAAGAATCTGGAA  666

Query  667  GAAAACATAAACATTCTTGACAAGAGCTACAGTAGTGAGGAAAAATGCAGGATCACGTTAGCCAATGGTGACTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAAACATAAACATTCTTGACAAGAGCTACAGTAGTGAGGAAAAATGCAGGATCACGTTAGCCAATGGTGACTG  740

Query  741  GAAACAAGACAGCCTACTTCATAAAAACCCCACAGTGACACACACAAAAGAGCCTGAAACGTACAAAAAGAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAACAAGACAGCCTACTTCATAAAAACCCCACAGTGACACACACAAAAGAGCCTGAAACGTACAAAAAGAAAG  814

Query  815  TTGCAGAACAGACATATTTTTGCAAACAGCTTGCCAAGAGGAAGTGGCAGTTATATAAAAACTACTGTGGTGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGCAGAACAGACATATTTTTGCAAACAGCTTGCCAAGAGGAAGTGGCAGTTATATAAAAACTACTGTGGTGAA  888

Query  889  ACTGTGGCTCTTTTTAAAAACAAAGTATTTTCAGCCCTTTTCATTGCTATCTTACTCTTTGACATCGGAGGGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGTGGCTCTTTTTAAAAACAAAGTATTTTCAGCCCTTTTCATTGCTATCTTACTCTTTGACATCGGAGGGTT  962

Query  963  TCCACCTTCATTACTTATGGAAGATGTAGCAAGAAGTTCAAACGTGAAAGAAGAAGAGTTTATTATGCCACTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCACCTTCATTACTTATGGAAGATGTAGCAAGAAGTTCAAACGTGAAAGAAGAAGAGTTTATTATGCCACTTA  1036

Query 1037  TTTCCATTATAGGCATTATGACAGCAGTTGGTAAACTGCTTTTAGGGATACTGGCTGACTTCAAGTGGATTAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTCCATTATAGGCATTATGACAGCAGTTGGTAAACTGCTTTTAGGGATACTGGCTGACTTCAAGTGGATTAAT  1110

Query 1111  ACCTTGTATCTTTATGTTGCTACCTTAATCATCATGGGCCTAGCCTTGTGTGCAATTCCATTTGCCAAAAGCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTTGTATCTTTATGTTGCTACCTTAATCATCATGGGCCTAGCCTTGTGTGCAATTCCATTTGCCAAAAGCTA  1184

Query 1185  TGTCACATTGGCGTTGCTTTCTGGGATCCTAGGGTTTCTTACTGGTAATTGGTCCATCTTTCCATATGTGACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTCACATTGGCGTTGCTTTCTGGGATCCTAGGGTTTCTTACTGGTAATTGGTCCATCTTTCCATATGTGACCA  1258

Query 1259  CGAAGACTGTGGGAATTGAAAAATTAGCCCATGCCTATGGGATATTAATGTTCTTTGCTGGACTTGGAAATAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGAAGACTGTGGGAATTGAAAAATTAGCCCATGCCTATGGGATATTAATGTTCTTTGCTGGACTTGGAAATAGC  1332

Query 1333  CTAGGACCACCCATCGT---------------------------------------------------------  1349
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 1333  CTAGGACCACCCATCGTTGGTAAGATATTTATCTTAAAATCATCCCATTTTACTGTTCTTCCTTGTCATATCTC  1406

Query 1350  ---------------------------------------------------------------------TGGTT  1354
                                                                                 |||||
Sbjct 1407  CAGATATAGAGGTCCAGATTGTAATAGTAGCACAGATTTGTACAAAAGAAATCTGCATGGAACATCTCATGGTT  1480

Query 1355  GGTTTTATGACTGGACCCAGACCTATGATATTGCATTTTATTTTAGTGGCTTCTGCGTCCTGCTGGGAGGTTTT  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTTTTATGACTGGACCCAGACCTATGATATTGCATTTTATTTTAGTGGCTTCTGCGTCCTGCTGGGAGGTTTT  1554

Query 1429  ATTCTGCTGCTGGCAGCCTTGCCCTCTTGGGATACATGCAACAAGCAACTCCCCAAGCCAGCTCCAACAACTTT  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTCTGCTGCTGGCAGCCTTGCCCTCTTGGGATACATGCAACAAGCAACTCCCCAAGCCAGCTCCAACAACTTT  1628

Query 1503  CTTGTACAAAGTTGCCTCTAATGTT  1527
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTGTACAAAGTTGCCTCTAATGTT  1653