Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00003
• Subject: NM_000663.4
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1500
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCTCCATGTTGCTCGCCCAGCGCCTGGCCTGCAGCTTCCAGCACAGCTACCGCCTGCTGGTGCCTGGATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCCATGTTGCTCGCCCAGCGCCTGGCCTGCAGCTTCCAGCACAGCTACCGCCTGCTGGTGCCTGGATC  74

Query   75  CAGACACATTAGTCAAGCTGCAGCCAAAGTCGACGTTGAATTTGATTATGATGGGCCTCTGATGAAGACGGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGACACATTAGTCAAGCTGCAGCCAAAGTCGACGTTGAATTTGATTATGATGGGCCTCTGATGAAGACGGAAG  148

Query  149  TCCCAGGGCCTAGATCTCAGGAGTTAATGAAACAGCTGAATATAATTCAGAATGCAGAGGCTGTGCATTTTTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCAGGGCCTAGATCTCAGGAGTTAATGAAACAGCTGAATATAATTCAGAATGCAGAGGCTGTGCATTTTTTC  222

Query  223  TGCAATTACGAAGAGAGCCGAGGCAATTACCTGGTTGATGTGGACGGCAACCGAATGCTGGATCTTTATTCCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAATTACGAAGAGAGCCGAGGCAATTACCTGGTTGATGTGGACGGCAACCGAATGCTGGATCTTTATTCCCA  296

Query  297  GATCTCCTCTGTCCCCATAGGTTACAGCCACCCCGCCCTGCTGAAACTCATCCAACAGCCTCAAAATGCGAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCTCCTCTGTCCCCATAGGTTACAGCCACCCCGCCCTGCTGAAACTCATCCAACAGCCTCAAAATGCGAGCA  370

Query  371  TGTTTGTCAACAGACCCGCCCTCGGAATCCTGCCTCCGGAGAACTTTGTGGAGAAGCTCCGGCAGTCCTTGCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTTTGTCAACAGACCCGCCCTCGGAATCCTGCCTCCGGAGAACTTTGTGGAGAAGCTCCGGCAGTCCTTGCTC  444

Query  445  TCGGTGGCTCCCAAAGGGATGTCCCAGCTCATCACCATGGCCTGCGGCTCCTGCTCCAATGAAAACGCCTTAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCGGTGGCTCCCAAAGGGATGTCCCAGCTCATCACCATGGCCTGCGGCTCCTGCTCCAATGAAAACGCCTTAAA  518

Query  519  GACCATCTTCATGTGGTACCGGAGCAAGGAAAGAGGGCAGAGGGGCTTCTCCCAGGAGGAGCTGGAGACGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACCATCTTCATGTGGTACCGGAGCAAGGAAAGAGGGCAGAGGGGCTTCTCCCAGGAGGAGCTGGAGACGTGCA  592

Query  593  TGATTAACCAGGCCCCTGGCTGCCCCGACTACAGCATCCTCTCCTTCATGGGCGCGTTCCATGGGAGGACCATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATTAACCAGGCCCCTGGCTGCCCCGACTACAGCATCCTCTCCTTCATGGGCGCGTTCCATGGGAGGACCATG  666

Query  667  GGTTGCTTAGCGACCACGCACTCTAAAGCCATTCACAAGATCGACATCCCTTCCTTTGACTGGCCCATCGCACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTTGCTTAGCGACCACGCACTCTAAAGCCATTCACAAGATCGACATCCCTTCCTTTGACTGGCCCATCGCACC  740

Query  741  GTTCCCACGGCTGAAATACCCTCTGGAAGAGTTTGTGAAAGAGAACCAACAGGAGGAGGCCCGCTGTCTGGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTCCCACGGCTGAAATACCCTCTGGAAGAGTTTGTGAAAGAGAACCAACAGGAGGAGGCCCGCTGTCTGGAAG  814

Query  815  AGGTGGAGGATCTGATTGTGAAATATCGGAAAAAGAAGAAGACGGTGGCCGGGATCATCGTGGAGCCCATCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTGGAGGATCTGATTGTGAAATATCGGAAAAAGAAGAAGACGGTGGCCGGGATCATCGTGGAGCCCATCCAG  888

Query  889  TCCGAGGGTGGAGACAACCACGCATCCGATGACTTCTTTCGGAAGCTGAGAGACATCGCCAGGAAGCATGGCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCGAGGGTGGAGACAACCACGCATCCGATGACTTCTTTCGGAAGCTGAGAGACATCGCCAGGAAGCATGGCTG  962

Query  963  CGCCTTCTTGGTGGACGAGGTCCAGACCGGAGGAGGCTGCACGGGCAAGTTCTGGGCCCATGAGCACTGGGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCTTCTTGGTGGACGAGGTCCAGACCGGAGGAGGCTGCACGGGCAAGTTCTGGGCCCATGAGCACTGGGGCC  1036

Query 1037  TGGATGACCCAGCAGACGTGATGACCTTCAGCAAGAAGATGATGACTGGGGGCTTCTTCCACAAGGAGGAGTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGATGACCCAGCAGACGTGATGACCTTCAGCAAGAAGATGATGACTGGGGGCTTCTTCCACAAGGAGGAGTTC  1110

Query 1111  AGGCCTAATGCTCCCTACCGGATCTTCAACACCTGGCTGGGGGACCCGTCCAAGAACCTGTTGCTGGCTGAGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGCCTAATGCTCCCTACCGGATCTTCAACACCTGGCTGGGGGACCCGTCCAAGAACCTGTTGCTGGCTGAGGT  1184

Query 1185  CATCAACATCATCAAGCGGGAGGACCTGCTAAATAATGCAGCCCATGCCGGGAAGGCCCTGCTCACAGGACTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCAACATCATCAAGCGGGAGGACCTGCTAAATAATGCAGCCCATGCCGGGAAGGCCCTGCTCACAGGACTGC  1258

Query 1259  TGGACCTCCAGGCCCGGTACCCCCAGTTCATCAGCAGGGTGAGAGGACGAGGCACCTTTTGCTCCTTCGATACT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGACCTCCAGGCCCGGTACCCCCAGTTCATCAGCAGGGTGAGAGGACGAGGCACCTTTTGCTCCTTCGATACT  1332

Query 1333  CCCGATGATTCCATACGGAATAAGCTCATTTTAATTGCCAGAAACAAAGGTGTGGTGTTGGGTGGCTGTGGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCGATGATTCCATACGGAATAAGCTCATTTTAATTGCCAGAAACAAAGGTGTGGTGTTGGGTGGCTGTGGTGA  1406

Query 1407  CAAATCCATTCGTTTCCGTCCCACGCTGGTCTTCAGGGATCACCACGCTCACCTGTTCCTCAATATTTTCAGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAATCCATTCGTTTCCGTCCCACGCTGGTCTTCAGGGATCACCACGCTCACCTGTTCCTCAATATTTTCAGTG  1480

Query 1481  ACATCTTAGCAGACTTCAAG  1500
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACATCTTAGCAGACTTCAAG  1500