Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00016
• Subject: XM_006515389.2
• Aligned Length: 2821
• Identities: 2032
• Gaps: 362

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC  296
                                          ||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||..|.|||||
Sbjct    1  ------------------------------ATGCTGCTCCTGGAGGTCATCTCAGGTGAACGCTTGGCCAAGCC  44

Query  297  GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG  370
            .|||.|.||.|||||||||||||||||.|||..|||.||.|||||.||..||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct   45  AGAGAGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAACAAGGCCTTGGATTTCATAGCCAGCAAAGGGG  118

Query  371  TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC  444
            ||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  119  TCAAGCTGGTGTCCATCGGAGCTGAAGAAATTGTGGATGGGAATGTGAAGATGACCCTGGGCATGATCTGGACC  192

Query  445  ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG  518
            |||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.|||||
Sbjct  193  ATCATTCTCCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACTTCAGCTAAAGAAGGGTTACTCCTGTGGTG  266

Query  519  CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT  592
            .|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  267  TCAGAGGAAGACAGCCCCATATAAAAATGTCAACATCCAAAACTTCCACATCAGTTGGAAAGATGGTCTTGGTT  340

Query  593  TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC  666
            ||..||||.||||||||||.|||.|.||.|||.|||||||.||||..|||||..|.|||||.||.||..||||.
Sbjct  341  TCTGTGCCTTGATCCACCGACACCGGCCCGAGTTGATTGACTATGGAAAGCTTCGAAAGGATGATCCACTCACA  414

Query  667  AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT  740
            ||||||||||..|||||.||.|||||.||||..|.|||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  415  AACCTGAACACGGCCTTTGATGTGGCAGAGAGGTTCCTGGACATCCCTAAGATGCTGGATGCTGAAGACATCGT  488

Query  741  --GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGC  812
              ||  ||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  489  CGGA--ACTGCCCGGCCAGATGAGAAAGCCATTATGACTTATGTGTCTAGCTTCTATCATGCCTTCTCTGGAGC  560

Query  813  GCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGG  886
            .||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  561  CCAGAAGGCAGAAACAGCAGCCAATCGCATCTGCAAAGTGTTGGCGGTCAATCAAGAGAACGAGCAGCTTATGG  634

Query  887  AGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTG  960
            |.|||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct  635  AAGACTATGAGAAGCTGGCCAGTGATCTGTTGGAGTGGATCCGCCGCACCATCCCATGGCTGGAGAATCGGGTG  708

Query  961  CCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCC  1034
            ||..|.||.||.||.||.|..||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||||||||
Sbjct  709  CCTGAGAACACCATGCATGCCATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGACGCCTGCACAAGCCGCC  782

Query 1035  CAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGC  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  783  CAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTTAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCGGC  856

Query 1109  CCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCT--GGCAGCACTTGGAGCAGGCTG  1180
            |.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.||  |||.|  |.||||.|||||.|
Sbjct  857  CTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCGGATATCAACAATGCCTGGGGCTG--CCTGGAACAGGCCG  928

Query 1181  AGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTC  1254
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct  929  AGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGGAGGCTAGAGAGGTTGGACCACCTGGCAGAGAAGTTC  1002

Query 1255  CGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGAC  1328
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||...|||...|||.||.|||||
Sbjct 1003  CGGCAGAAGGCCTCCATCCATGAAGCCTGGACGGATGGCAAAGAAGCCATGCTTCGGCAGAAGGATTATGAGAC  1076

Query 1329  GGCCACACTATCGGACATCAAAGCC---CTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACC  1399
            .|||||.||.||.||.|||||.|||   ||||   ..|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1077  AGCCACCCTGTCCGAGATCAAGGCCTTGCTCA---AGAAGCACGAGGCTTTTGAGAGTGATCTGGCTGCCCACC  1147

Query 1400  AGGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTC-CCACAATGT  1472
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||| ||| |.|||
Sbjct 1148  AGGACCGCGTGGAGCAGATTGCGGCCATTGCCCAGGAGCTTAATGAGCTGGACTACTATGACTCGCCA-AGTGT  1220

Query 1473  CAACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCC  1546
            ||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||...||.||..||||.||.||.|..||.||||||||..
Sbjct 1221  CAACGCTCGTTGCCAAAAGATCTGTGACCAGTGGGACAATCTAGGGGCTCTCACTCAGAAGCGGAGGGAAGCTT  1294

Query 1547  TGGAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTC  1620
            |.|||..|||||||||||.||||||..|||||||||||||..||.|.||.|||||||||.|.||.||.||||||
Sbjct 1295  TAGAGCGAACAGAGAAGCTGCTGGAAACCATCGACCAGCTCTACTTAGAGTACGCCAAGAGGGCTGCACCCTTC  1368

Query 1621  AACAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGG  1694
            |||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct 1369  AACAATTGGATGGAGGGAGCCATGGAGGACCTGCAGGACACCTTCATCGTACATACCATCGAGGAGATCCAGGG  1442

Query 1695  CCTGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCA  1768
            .||||.|.||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|.|||||||...|||||.||||.||
Sbjct 1443  ACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTCCCGGATGCAGACAAGGAGCGCCTCGCCATTCTGGGCA  1516

Query 1769  TCCACAAGGA---GGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACC  1839
            |||||||.||   |.||   |.|||||...|||.|.|.||..||||..||.|.||||.|||||||||.||.|||
Sbjct 1517  TCCACAATGAAGTGTCC---AAGATCGTCCAGACCTATCATGTCAACATGGCAGGCACCAACCCCTATACAACC  1587

Query 1840  GTCACCCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAAC----GGGACCATGCCC  1909
            .||||.||.||....|||||...|||.|||||..|.||.|.||||||.|||||    |    |||||||.||.|
Sbjct 1588  ATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCATGTACGGCAGCTAGTGCC----CCGGAGGGACCAGGCTC  1657

Query 1910  TCCTGGAGGAGCAGAGCAA-GCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGC-CAGGCCAATGTTG  1981
            ||...|||||.|| .|||| |||||||..|||.|||...||.|||...|||||.|.| || ||.||||||||..
Sbjct 1658  TCACAGAGGAACA-TGCAAGGCAGCAGCACAATGAGAGGCTACGCAAACAGTTTGGC-GCACAAGCCAATGTCA  1729

Query 1982  TGGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGAC  2055
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1730  TTGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATTGGGAGGATTTCCATTGAGATGCACGGCACCCTGGAGGAC  1803

Query 2056  CAGCTGAGCCACCTGAAGCAGTATGA-ACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGC  2128
            ||.||.|||||||||..||||||||| |.| ||||||||..|.||||||||.||..|.||||.||||||| .||
Sbjct 1804  CAACTCAGCCACCTGCGGCAGTATGAGAAG-AGCATCGTCAATTACAAGCCAAAGATTGACCAGCTGGAG-TGC  1875

Query 2129  -AGCACCAGCTCATCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGT  2201
             |.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||
Sbjct 1876  GACCACCAGCTCATCCAGGAGGCACTTATCTTTGACAATAAGCACACCAACTACAACATGGAGCATATCCGTGT  1949

Query 2202  GGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACG  2275
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct 1950  GGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCAGGACCATCAATGAAGTGGAGAACCAGATCTTGACCCGGGATG  2023

Query 2276  CCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGG  2349
            ||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||..||||||...|||.
Sbjct 2024  CCAAAGGCATCAGCCAGGAACAGATGAACGAATTCCGCGCCTCTTTCAACCACTTTGACCGGGATCACTCCGGC  2097

Query 2350  GCGCTGGGGCCCGAGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACC----------  2413
            .||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||..|.|..|||||||          
Sbjct 2098  ACGTTGGGTCCCGAAGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGGTTATGATATTGGCAACGACCCCCAGAAGAA  2171

Query 2414  ----GGCA----------------------------------------------------GGGTGAGGCCGAGT  2431
                ||||                                                    |||.|||||.||||
Sbjct 2172  GACGGGCATGATGGACACAGACGATTTCCGCGCCTGCCTTATCTCCATGGGTTACAACATGGGAGAGGCAGAGT  2245

Query 2432  TCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGC---GGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTC  2502
            |...|||.|||||||||.|.||.||||||||||   ||   ||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 2246  TTGCCCGAATCATGAGCATTGTAGACCCCAACC---GCTTGGGGGTAGTGACGTTCCAGGCCTTCATCGACTTT  2316

Query 2503  ATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAA  2576
            |||||.||.|||||..|.||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.||.||.||
Sbjct 2317  ATGTCCCGAGAGACGGCAGATACTGATACTGCAGATCAGGTCATGGCTTCCTTCAAGATCCTGGCTGGAGATAA  2390

Query 2577  GAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGG  2650
            |||.|.||||||||..||.||||||||..|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||..|.||||
Sbjct 2391  GAATTACATCACAGAGGATGAGCTGCGCCGTGAGCTGCCCCCTGACCAAGCCGAGTACTGCATCGCAAGAATGG  2464

Query 2651  CGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAG  2724
            |.||.|||..||||||.|||.|||||||||||||..|.|||||||.|||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 2465  CCCCCTACGCGGGCCCCGACTCCGTGCCCGGTGCTTTAGACTACATGTCCTTCTCCACGGCACTGTATGGCGAG  2538

Query 2725  AGCGACCTG  2733
            ||||||||.
Sbjct 2539  AGCGACCTC  2547