Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00016
• Subject: XM_006723406.3
• Aligned Length: 2738
• Identities: 2713
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG  74
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Sbjct    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG  74

Query   75  GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA  148
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Sbjct   75  GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA  148

Query  149  AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT  222

Query  223  GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC  296
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Sbjct  223  GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC  296

Query  297  GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG  370
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Sbjct  297  GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG  370

Query  371  TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC  444
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Sbjct  371  TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC  444

Query  445  ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG  518
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Sbjct  445  ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG  518

Query  519  CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT  592
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Sbjct  519  CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT  592

Query  593  TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC  666

Query  667  AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT  740
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Sbjct  667  AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGATATTGT  740

Query  741  GAACACGGCCC-----GGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGG  809
            |     |||.|     ||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  741  G-----GGCACTCTGAGGCCAGATGAGAAGGCCATCATGACTTACGTGTCCTGCTTCTACCACGCTTTCTCGGG  809

Query  810  AGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGA  883
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  GGCTCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGA  883

Query  884  TGGAGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGT  957
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Sbjct  884  TGGAGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGT  957

Query  958  GTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCC  1031
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Sbjct  958  GTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCC  1031

Query 1032  GCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACC  1105
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Sbjct 1032  GCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACC  1105

Query 1106  GGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCT  1179
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Sbjct 1106  GGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCT  1179

Query 1180  GAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTT  1253
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Sbjct 1180  GAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTT  1253

Query 1254  CCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGA  1327
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Sbjct 1254  CCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGA  1327

Query 1328  CGGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAG  1401
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Sbjct 1328  CGGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAG  1401

Query 1402  GACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAA  1475
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Sbjct 1402  GACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAA  1475

Query 1476  CACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGG  1549
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Sbjct 1476  CACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGG  1549

Query 1550  AGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAAC  1623
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Sbjct 1550  AGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAAC  1623

Query 1624  AACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCT  1697
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Sbjct 1624  AACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCT  1697

Query 1698  GATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCC  1771
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Sbjct 1698  GATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCC  1771

Query 1772  ACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACC  1845
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Sbjct 1772  ACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACC  1845

Query 1846  CCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGA  1919
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Sbjct 1846  CCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGA  1919

Query 1920  GCAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGA  1993
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Sbjct 1920  GCAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGA  1993

Query 1994  TCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCAC  2067
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Sbjct 1994  TCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCAC  2067

Query 2068  CTGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCAT  2141
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Sbjct 2068  CTGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCAT  2141

Query 2142  CCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGC  2215
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Sbjct 2142  CCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGC  2215

Query 2216  TGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGC  2289
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Sbjct 2216  TGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGC  2289

Query 2290  CAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGCTGGGGCCCGA  2363
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Sbjct 2290  CAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGCTGGGGCCCGA  2363

Query 2364  GGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGAGTTCAACC  2437
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Sbjct 2364  GGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGAGTTCAACC  2437

Query 2438  GCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCATGTCGCGG  2511
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Sbjct 2438  GCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCATGTCGCGG  2511

Query 2512  GAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAGAACTTCAT  2585
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Sbjct 2512  GAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAGAACTTCAT  2585

Query 2586  CACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCGCCATACC  2659
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Sbjct 2586  CACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCGCCATACC  2659

Query 2660  AGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGAGCGACCTG  2733
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Sbjct 2660  AGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGAGCGACCTG  2733