Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00024
- Subject:
- XM_006711925.1
- Aligned Length:
- 3501
- Identities:
- 3432
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
Query 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
Query 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
Query 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
Query 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
Query 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
Query 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
Query 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
Query 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG 666
Query 667 CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC 740
Query 741 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 814
Query 815 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 888
Query 889 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 962
Query 963 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 1036
Query 1037 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 1110
Query 1111 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 1184
Query 1185 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 1258
Query 1259 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 1332
Query 1333 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGG--------------------------------------------------- 1355
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGCGGATCAAAGATTGAAGAAAGATTGTACTCCTGTGTCGTGGCTCCAACACT 1406
Query 1356 ---------------GCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC 1414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGGCTGAGATGGGAGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC 1480
Query 1415 CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG 1554
Query 1489 CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC 1628
Query 1563 AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG 1702
Query 1637 AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAG 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAG 1776
Query 1711 GACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCT 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCT 1850
Query 1785 TGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGA 1924
Query 1859 TGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTC 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTC 1998
Query 1933 TGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGAT 2006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGAT 2072
Query 2007 TCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCT 2080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCT 2146
Query 2081 TCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATG 2154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATG 2220
Query 2155 GCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAAC 2228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAAC 2294
Query 2229 GGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGC 2302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGC 2368
Query 2303 TGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTC 2376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTC 2442
Query 2377 TATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTT 2516
Query 2451 AGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGA---CAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACT 2521
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGCAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACT 2590
Query 2522 CTATGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGG 2595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTATGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGG 2664
Query 2596 ACACTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGC 2669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACACTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGC 2738
Query 2670 CTTGGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGT 2743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CTTGGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGT 2812
Query 2744 ATAGCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAG 2817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATAGCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAG 2886
Query 2818 AGCATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGA 2891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGCATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGA 2960
Query 2892 CAATCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCC 2965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CAATCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCC 3034
Query 2966 CCGATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTG 3039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CCGATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTG 3108
Query 3040 GCTGACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTT 3113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GCTGACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTT 3182
Query 3114 CATGCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACA 3187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CATGCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACA 3256
Query 3188 TCTGGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAA 3261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TCTGGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAA 3330
Query 3262 GAAACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGG 3335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GAAACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGG 3404
Query 3336 GGAGCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGC 3409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GGAGCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGC 3478
Query 3410 CCCACCAGGTGGTGGACAACTCC 3432
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CCCACCAGGTGGTGGACAACTCC 3501