Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00024
• Subject: XM_017003186.1
• Aligned Length: 3498
• Identities: 3432
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC  74

Query   75  CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC  148

Query  149  CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC  222

Query  223  CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT  296

Query  297  CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC  370

Query  371  TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC  444

Query  445  GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT  518

Query  519  CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT  592

Query  593  GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG  666

Query  667  CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC  740

Query  741  TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA  814

Query  815  GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG  888

Query  889  AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT  962

Query  963  CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG  1036

Query 1037  AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC  1110

Query 1111  TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT  1184

Query 1185  GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG  1258

Query 1259  TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG  1332

Query 1333  ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGG---------------------------------------------------  1355
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 1333  ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGCGGATCAAAGATTGAAGAAAGATTGTACTCCTGTGTCGTGGCTCCAACACT  1406

Query 1356  ---------------GCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC  1414
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGGCTGAGATGGGAGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGTGGAGC  1480

Query 1415  CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCTCCAAG  1554

Query 1489  CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC  1562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCTTCCTC  1628

Query 1563  AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG  1636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCACGTCGG  1702

Query 1637  AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAG  1710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAG  1776

Query 1711  GACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCT  1784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCT  1850

Query 1785  TGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGA  1858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGA  1924

Query 1859  TGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTC  1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTC  1998

Query 1933  TGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGAT  2006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGAT  2072

Query 2007  TCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCT  2080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCT  2146

Query 2081  TCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATG  2154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATG  2220

Query 2155  GCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAAC  2228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAAC  2294

Query 2229  GGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGC  2302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGC  2368

Query 2303  TGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTC  2376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTC  2442

Query 2377  TATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTT  2450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTT  2516

Query 2451  AGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTA  2524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTA  2590

Query 2525  TGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACA  2598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACA  2664

Query 2599  CTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTT  2672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTT  2738

Query 2673  GGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATA  2746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATA  2812

Query 2747  GCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGC  2820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGC  2886

Query 2821  ATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAA  2894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAA  2960

Query 2895  TCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCG  2968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCG  3034

Query 2969  ATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCT  3042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCT  3108

Query 3043  GACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCAT  3116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCAT  3182

Query 3117  GCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCT  3190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCT  3256

Query 3191  GGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAA  3264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  GGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAA  3330

Query 3265  ACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGA  3338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  ACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGA  3404

Query 3339  GCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCC  3412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  GCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCC  3478

Query 3413  ACCAGGTGGTGGACAACTCC  3432
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  ACCAGGTGGTGGACAACTCC  3498