Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00024
- Subject:
- XM_017003191.1
- Aligned Length:
- 3563
- Identities:
- 2786
- Gaps:
- 772
Alignment
Query 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCG-----TGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGC 661
.||| || ||||| |.||| |||| ||||..|.||
Sbjct 1 -----ATGC-----TT--TCCTG-----CCCCGAGTGTTGGC-------------------CTCACCGAGA--- 35
Query 662 AGCTGCTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTAC 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 36 ----------GGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTAC 99
Query 736 ATGGCTGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGA 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 ATGGCTGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGA 173
Query 810 GCAGAGCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACA 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 GCAGAGCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACA 247
Query 884 TGAAGAAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGC 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 TGAAGAAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGC 321
Query 958 ATCCTCTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCT 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 ATCCTCTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCT 395
Query 1032 CAACGAGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACT 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CAACGAGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACT 469
Query 1106 GCTACTACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 GCTACTACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCC 543
Query 1180 ATGGTGGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGG 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 ATGGTGGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGG 617
Query 1254 CACCGTGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCA 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 CACCGTGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCA 691
Query 1328 ACAAGATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGG---------------------------------------------- 1355
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 ACAAGATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGCGGATCAAAGATTGAAGAAAGATTGTACTCCTGTGTCGTGGCTCCA 765
Query 1356 --------------------GCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGT 1409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 ACACTGAGGCTGAGATGGGAGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGATGT 839
Query 1410 GGAGCCAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCT 1483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GGAGCCAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTGCCT 913
Query 1484 CCAAGCCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCT 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 CCAAGCCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCAGCT 987
Query 1558 TCCTCAAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCAC 1631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 TCCTCAAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTCCAC 1061
Query 1632 GTCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCC---------------------------------------------- 1659
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 GTCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGCTCTTCCCCACCACTCTGTCCCATCTGCCCCACTCACGCTGCC 1135
Query 1660 -----------CAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAGGACCTGGCTGAC 1722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 TCCCTGGCTCACAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGCGCCTGCAGGACCTGGCTGAC 1209
Query 1723 CGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCTTGAGCGAGAGTC 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 CGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAGGCCCTGCTTGAGCGAGAGTC 1283
Query 1797 CGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGATGGAAACCCGCT 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 CGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGACCCCGAGATGGAAACCCGCT 1357
Query 1871 ACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTCTGCACGGCCCTG 1944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 ACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCGTCCTGCTCTGCACGGCCCTG 1431
Query 1945 GTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGATTCTGCTCCTCAT 2018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 GTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTGGGGGAGATTCTGCTCCTCAT 1505
Query 2019 CCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCTTCTCAACTTGGA 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 CCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCTTGTGGCCTTCTCAACTTGGA 1579
Query 2093 TTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATGGCAAATGTCGTG 2166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580 TTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCCTGGTGATGGCAAATGTCGTG 1653
Query 2167 GACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAACGGAGGGCAGCTG 2240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654 GACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGGATGGAAACGGAGGGCAGCTG 1727
Query 2241 CCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGCTGGTGCAGGTCA 2314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 CCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCACCATCATGCTGGTGCAGGTCA 1801
Query 2315 GCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTCTATGCCTGGCGT 2388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 GCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCATCAACCTCTATGCCTGGCGT 1875
Query 2389 CCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTTAGAGCAGATGCA 2462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876 CCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATGGTGGCCTTAGAGCAGATGCA 1949
Query 2463 AGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGA---CAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTATGACGGTGA 2533
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 AGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGCAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAAGTACTCTATGACGGTGA 2023
Query 2534 TGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACACTTTTCTTG 2607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024 TGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGGCACGGACACTTTTCTTG 2097
Query 2608 TGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTTGGTCACCAA 2681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 TGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAACGAGGCCTTGGTCACCAA 2171
Query 2682 CATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATAGCCAGACGT 2755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2172 CATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGAGCTGTATAGCCAGACGT 2245
Query 2756 ATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGCATCAACAAT 2829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 ATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAGAGGAGAGCATCAACAAT 2319
Query 2830 GGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAATCCCAAGTT 2903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2320 GGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTCCTGGACAATCCCAAGTT 2393
Query 2904 CCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCGATGTCAACA 2977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 CCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGTCACCCCCGATGTCAACA 2467
Query 2978 CCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCTGACCTGGCC 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2468 CCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGCACCTGGCTGACCTGGCC 2541
Query 3052 GACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCATGCTGCGCAT 3125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 GACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAATAACTTCATGCTGCGCAT 2615
Query 3126 AGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCTGGGGCAATA 3199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2616 AGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTACGACATCTGGGGCAATA 2689
Query 3200 CAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAAACCCAAGTC 3273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 CAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGGTAGAAGAAACCCAAGTC 2763
Query 3274 ATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGAGCTGCTGAC 3347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2764 ATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGGAAGGGGGAGCTGCTGAC 2837
Query 3348 CTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCCACCAGGTGG 3421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2838 CTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCACACTGCCCCACCAGGTGG 2911
Query 3422 TGGACAACTCC 3432
|||||||||||
Sbjct 2912 TGGACAACTCC 2922
