Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00024
- Subject:
- XM_017003193.1
- Aligned Length:
- 3432
- Identities:
- 2709
- Gaps:
- 723
Alignment
Query 1 ATGCCGAGGAACCAGGGCTTCTCCGAGCCCGAATACTCGGCCGAGTACTCAGCCGAGTACTCCGTCAGCCTGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCCGACCCTGACCGCGGGGTGGGCCGGACCCATGAAATCTCGGTCCGGAACTCGGGCTCCTGCCTGTGCCTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTCGCTTCATGCGGCTGACTTTCGTGCCGGAGTCCTTGGAGAACCTCTACCAGACCTACTTCAAAAGGCAGCGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CACGAGACCCTGCTGGTGCTGGTGGTCTTTGCAGCCCTCTTTGACTGCTACGTGGTGGTCATGTGTGCTGTGGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTTCTCCAGCGACAAGCTGGCTTCCCTCGCCGTGGCTGGAATTGGACTGGTGTTGGACATCATCCTCTTCGTGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCTGCAAAAAGGGGCTGCTCCCGGACCGGGTCACCCGCAGAGTGCTGCCCTACGTGCTGTGGCTGCTCATAACC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCCCAGATCTTCTCCTACCTGGGCCTGAACTTCGCGCGTGCCCACGCGGCTAGTGACACGGTGGGCTGGCAGGT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTTCTTTGTCTTCTCCTTCTTCATCACGCTGCCCCTCAGCCTCAGCCCCATCGTGATCATCTCCGTGGTCTCCT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GTGTGGTGCACACGTTGGTCCTGGGGGTCACCGTGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCTCAAGGGGATGCAGCTG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CTGCGGGAGATCCTGGCCAACGTCTTCCTCTACCTGTGCGCCATCGCTGTGGGCATCATGTCCTACTACATGGC 740
|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------ATGTCCTACTACATGGC 17
Query 741 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 18 TGACCGCAAGCACCGCAAGGCCTTCCTGGAGGCCCGCCAGTCGCTGGAGGTGAAGATGAACCTGGAAGAGCAGA 91
Query 815 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 GCCAGCAGCAGGAGAACCTCATGCTTTCCATCCTGCCCAAGCACGTGGCTGACGAGATGCTGAAAGACATGAAG 165
Query 889 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 AAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGTTCAACACCATGTACATGTACCGTCACGAGAACGTCAGCATCCT 239
Query 963 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CTTTGCCGACATCGTGGGCTTTACCCAGCTGTCTTCTGCCTGCAGTGCCCAGGAGCTTGTGAAGCTGCTCAACG 313
Query 1037 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 AGCTCTTTGCCCGCTTTGACAAGCTGGCAGCTAAATACCACCAGCTGCGGATTAAGATCCTGGGCGACTGCTAC 387
Query 1111 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 TACTGCATCTGCGGCTTGCCCGACTACCGGGAGGACCACGCCGTCTGCTCCATCCTCATGGGGCTGGCCATGGT 461
Query 1185 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GGAGGCCATCTCGTATGTGCGGGAGAAGACCAAGACTGGGGTGGACATGCGTGTGGGGGTGCACACGGGCACCG 535
Query 1259 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TGCTGGGGGGCGTCCTGGGCCAGAAGCGCTGGCAGTACGACGTGTGGTCGACTGATGTCACTGTAGCCAACAAG 609
Query 1333 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 ATGGAGGCCGGCGGCATCCCTGGGCGCGTGCACATCTCCCAGAGCACCATGGACTGCCTGAAAGGGGAGTTTGA 683
Query 1407 TGTGGAGCCAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 TGTGGAGCCAGGCGATGGGGGCAGCCGCTGTGATTACCTAGAAGAGAAGGGTATTGAAACCTACCTCATCATTG 757
Query 1481 CCTCCAAGCCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 CCTCCAAGCCAGAGGTGAAGAAAACAGCCACCCAGAATGGCCTCAATGGCTCGGCCCTGCCCAATGGAGCACCA 831
Query 1555 GCTTCCTCAAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 GCTTCCTCAAAGTCCAGCTCCCCTGCCCTCATTGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGTGCCCACAGCAGTGGGTC 905
Query 1629 CACGTCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 CACGTCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGATGCCCAGGCCGACAACCCCTCATTCCCCAACCCACGCCGGAGGCTGC 979
Query 1703 GCCTGCAGGACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 GCCTGCAGGACCTGGCTGACCGAGTGGTGGATGCCTCTGAAGATGAGCACGAGCTCAACCAGCTGCTCAACGAG 1053
Query 1777 GCCCTGCTTGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 GCCCTGCTTGAGCGAGAGTCCGCCCAAGTAGTAAAGAAGAGAAACACCTTCCTCTTGTCCATGCGGTTCATGGA 1127
Query 1851 CCCCGAGATGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 CCCCGAGATGGAAACCCGCTACTCGGTGGAGAAGGAGAAGCAGAGTGGGGCTGCCTTCAGCTGCTCCTGCGTCG 1201
Query 1925 TCCTGCTCTGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 TCCTGCTCTGCACGGCCCTGGTCGAGATACTCATCGACCCCTGGCTAATGACAAACTATGTGACCTTCATGGTG 1275
Query 1999 GGGGAGATTCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 GGGGAGATTCTGCTCCTCATCCTGACCATCTGCTCCCTGGCTGCCATCTTTCCCCGGGCCTTTCCTAAGAAGCT 1349
Query 2073 TGTGGCCTTCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 TGTGGCCTTCTCAACTTGGATTGACCGGACCCGCTGGGCCAGGAACACCTGGGCCATGCTCGCCATCTTCATCC 1423
Query 2147 TGGTGATGGCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 TGGTGATGGCAAATGTCGTGGACATGCTCAGCTGTCTCCAGTACTACACGGGACCCAGCAATGCAACGGCAGGG 1497
Query 2221 ATGGAAACGGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCAC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 ATGGAAACGGAGGGCAGCTGCCTGGAGAACCCCAAGTATTACAACTATGTGGCCGTGCTGTCCCTCATCGCCAC 1571
Query 2295 CATCATGCTGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572 CATCATGCTGGTGCAGGTCAGCCACATGGTGAAGCTCACGCTCATGCTGCTCGTCGCAGGCGCCGTGGCCACCA 1645
Query 2369 TCAACCTCTATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 TCAACCTCTATGCCTGGCGTCCCGTCTTTGATGAATACGACCACAAGCGTTTTCGGGAGCACGACTTACCTATG 1719
Query 2443 GTGGCCTTAGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 GTGGCCTTAGAGCAGATGCAAGGATTCAACCCTGGGCTCAATGGCACTGACAGGCTGCCCCTGGTGCCTTCCAA 1793
Query 2517 GTACTCTATGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 GTACTCTATGACGGTGATGGTGTTCCTCATGATGCTCAGCTTCTACTACTTCTCCCGCCACGTAGAAAAACTGG 1867
Query 2591 CACGGACACTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 CACGGACACTTTTCTTGTGGAAGATTGAGGTCCACGACCAGAAGGAACGTGTCTATGAGATGCGACGCTGGAAC 1941
Query 2665 GAGGCCTTGGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1942 GAGGCCTTGGTCACCAACATGTTGCCTGAGCACGTGGCACGCCATTTCCTGGGGTCCAAGAAGAGAGATGAGGA 2015
Query 2739 GCTGTATAGCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016 GCTGTATAGCCAGACGTATGATGAGATTGGAGTCATGTTTGCCTCCCTGCCCAACTTTGCTGACTTCTACACAG 2089
Query 2813 AGGAGAGCATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 AGGAGAGCATCAACAATGGTGGTATTGAGTGTCTGCGTTTCCTCAATGAAATCATCTCAGATTTTGACTCTCTC 2163
Query 2887 CTGGACAATCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2164 CTGGACAATCCCAAGTTCCGGGTGATCACCAAGATCAAAACCATTGGCAGCACGTATATGGCGGCTTCAGGAGT 2237
Query 2961 CACCCCCGATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 CACCCCCGATGTCAACACCAATGGCTTTGCCAGCTCCAACAAGGAAGACAAGTCCGAGAGAGAGCGCTGGCAGC 2311
Query 3035 ACCTGGCTGACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAAT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 ACCTGGCTGACCTGGCCGACTTCGCGCTGGCCATGAAGGATACGCTCACCAACATCAACAACCAGTCCTTCAAT 2385
Query 3109 AACTTCATGCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 AACTTCATGCTGCGCATAGGCATGAACAAAGGCGGGGTTCTGGCTGGGGTCATCGGAGCCCGGAAACCACACTA 2459
Query 3183 CGACATCTGGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGG 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 CGACATCTGGGGCAATACAGTCAATGTAGCCAGCAGGATGGAGTCCACGGGGGTCATGGGCAACATTCAGGTGG 2533
Query 3257 TAGAAGAAACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGG 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 TAGAAGAAACCCAAGTCATCCTCCGAGAGTACGGCTTCCGCTTTGTGAGGCGAGGCCCCATCTTTGTGAAGGGG 2607
Query 3331 AAGGGGGAGCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCAC 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2608 AAGGGGGAGCTGCTGACCTTCTTCTTGAAGGGGCGGGATAAGCTAGCCACCTTCCCCAATGGCCCCTCTGTCAC 2681
Query 3405 ACTGCCCCACCAGGTGGTGGACAACTCC 3432
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 ACTGCCCCACCAGGTGGTGGACAACTCC 2709
