Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00072
• Subject: NM_001320880.2
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1278
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  148
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  28

Query  149  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  102

Query  223  GCCCCACAGCCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  GCCCCACAGCCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTGG  176

Query  297  AGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  AGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCTG  250

Query  371  GTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAG---------  435
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  251  GTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAGATCAATACA  324

Query  436  ---------------------------------------------------------CCTGCCACAGTGACTCA  452
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  325  GATTCTTTTTCTTCCTATCCTGTTTTCTCTCCTGTTTCTTTGGATTATAGCAGTGAACCTGCCACAGTGACTCA  398

Query  453  GGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCAA  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  GGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCAA  472

Query  527  TGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  TGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAAA  546

Query  601  ATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATAT  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  ATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATAT  620

Query  675  GGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAGG  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAGG  694

Query  749  GAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGTC  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  GAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGTC  768

Query  823  AGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAACG  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  AGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAACG  842

Query  897  TTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGATG  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  TTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGATG  916

Query  971  CTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCACA  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  CTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCACA  990

Query 1045  AGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTGT  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  AGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTGT  1064

Query 1119  GAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCCT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  GAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCCT  1138

Query 1193  TCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGTC  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  TCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGTC  1212

Query 1267  ACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAAT  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  ACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAAT  1286

Query 1341  GATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTACCGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTACCGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1344