Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00072
• Subject: NM_009674.3
• Aligned Length: 1400
• Identities: 1217
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCCACCGGCTACCCGCCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74

Query   75  TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  148
            |||.|||.||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||..|
Sbjct   75  TTTCCCCACTGCGGGTCAGTACCCGTACCCTAGTGGCTTTCCACCAATGGGAGGAGGTGCTTACCCACCAGCAC  148

Query  149  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  222
            |||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  CAAGTGGTGGGTATCCAGGAGCTGGAGGCTACCCCGCACCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGGGGCTATCCTGGA  222

Query  223  GCCCCACAG-CCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTG  295
            ||||.| || ||||||||..|||||.|||||||.||         |||||||||.|||||.|.||||||.||||
Sbjct  223  GCCCTA-AGTCCAGGGGGTCCTCCAGCCTATCCTGG---------AGGCCAAGGCTTTGGGGCCCCACCCGGTG  286

Query  296  GAGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCT  369
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||||.
Sbjct  287  GAGCAGGCTTTTCTGGCTATCCACAGCCACCTGCACAGTCTTATGGTGGCGGACCAGCCCAGGTTCCAGTACCA  360

Query  370  GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAGCCTGCCAC  443
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||.|||||.||..|
Sbjct  361  GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCATCTCAGTACCCTGGAGGACAAGCTCCCTACCCTAGCCAGCCCGCTTC  434

Query  444  AGTGACTCAGGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTC  517
            ..|||||||||.|||.||||||||.||||..|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  435  GATGACTCAGGGCACCCAAGGAACAATCCTCCCAGCCTCCAACTTTGATGCTATGAGAGATGCAGAAATTCTCC  508

Query  518  GTAAGGCAATGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAG  591
            |.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct  509  GCAAAGCAATGAAAGGGTTTGGGACAGACGAGCAAGCAATTGTGGATGTTGTGTCTAACCGTTCCAATGACCAG  582

Query  592  AGGCAAAAAATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAG  665
            ||||||.||||.||||||||.|||||||||...|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  583  AGGCAACAAATCAAAGCAGCTTTTAAGACCATGTATGGCAAGGATTTAATTAAAGATCTCAAGTCAGAATTGAG  656

Query  666  TGGAAATATGGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAG  739
            |||.||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  657  TGGGAATATGGAAGAATTAATCCTTGCGCTGTTCATGCCTTCTACATACTATGATGCCTGGAGCTTACGGAAGG  730

Query  740  CAATGCAGGGAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGA  813
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  731  CAATGCAGGGAGCAGGAACTCAAGAACGTGTATTGATAGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAAGAAATTCGA  804

Query  814  GAAATTGTCAGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACA  887
            ||.|||||.||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  805  GACATTGTTAGATGTTACCAATTAGAATTTGGACGAGACCTTGAGAAGGACATTAGGTCAGATACCTCGGGACA  878

Query  888  TTTTGAACGTTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTC  961
            ||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||..|||||..|.||||||||.|||||.|
Sbjct  879  TTTTGAACGTCTCCTCGTGTCCATGTGCCAGGGAAACCGTGACGAGAGGCAGAGCGTGAACCACCAGATGGCCC  952

Query  962  AGGAAGATGCTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATC  1035
            ||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct  953  AGGAGGACGCTCAGCGTCTCTATCAGGCCGGGGAGGGGAGACTGGGAACGGATGAATCCTGTTTCAACATGATT  1026

Query 1036  CTTGCCACAAGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTT  1109
            ||.||||||||.|||||.||||||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 1027  CTCGCCACAAGGAGCTTCCCTCAGCTGAAGGCCACTATGGAGGCTTATTCCAGGATGGCTAATCGCGATTTGCT  1100

Query 1110  AAGCAGTGTGAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACC  1183
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1101  AAGCAGTGTAAGCCGAGAATTTTCGGGATACGTTGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGCGCCCTCAACC  1174

Query 1184  GCCCTGCCTTCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGG  1257
            |||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1175  GCCCTGCCTTCTTTGCTGAACGACTCTACTATTCCATGAAAGGCGCTGGCACGGACGACTCCACCCTGGTCAGG  1248

Query 1258  ATTGTGGTCACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1249  ATTGTGGTCACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTTCAGATAAAACAGATGTTCACCCAGATGTATCAGAAGACCCT  1322

Query 1332  GGGCACAATGATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTAC-CGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1398
            ..||||||||||.|||.|||||||||||||||||||| .|||| ||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1323  AAGCACAATGATCGCAAGTGACACGAGTGGAGATTACAGGAAG-CTGCTCCTGGCCATCGTTGGCCAG  1389