Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00072
• Subject: XM_006518453.3
• Aligned Length: 1466
• Identities: 1220
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCCACCGGCTACCCGCCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74

Query   75  TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  148
            |||.|||.||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||..|
Sbjct   75  TTTCCCCACTGCGGGTCAGTACCCGTACCCTAGTGGCTTTCCACCAATGGGAGGAGGTGCTTACCCACCAGCAC  148

Query  149  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  222
            |||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  CAAGTGGTGGGTATCCAGGAGCTGGAGGCTACCCCGCACCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGGGGCTATCCTGGA  222

Query  223  GCCCCACAG-CCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTG  295
            ||||.| || ||||||||..|||||.|||||||.||         |||||||||.|||||.|.||||||.||||
Sbjct  223  GCCCTA-AGTCCAGGGGGTCCTCCAGCCTATCCTGG---------AGGCCAAGGCTTTGGGGCCCCACCCGGTG  286

Query  296  GAGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCT  369
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||||.
Sbjct  287  GAGCAGGCTTTTCTGGCTATCCACAGCCACCTGCACAGTCTTATGGTGGCGGACCAGCCCAGGTTCCAGTACCA  360

Query  370  GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAG--------  435
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||.|||        
Sbjct  361  GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCATCTCAGTACCCTGGAGGACAAGCTCCCTACCCTAGCCAGATCAATAC  434

Query  436  -------------------CCTGC---------------------------CA------------CAGTGACTC  451
                               |||||                           ||            |..||||||
Sbjct  435  AGAATCCTCTTCTTCCTATCCTGCTTTCCCCCCTGTTTCTTTGGATTATAGCAGTGATCCCGCTTCGATGACTC  508

Query  452  AGGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCA  525
            |||.|||.||||||||.||||..|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  509  AGGGCACCCAAGGAACAATCCTCCCAGCCTCCAACTTTGATGCTATGAGAGATGCAGAAATTCTCCGCAAAGCA  582

Query  526  ATGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAA  599
            |||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct  583  ATGAAAGGGTTTGGGACAGACGAGCAAGCAATTGTGGATGTTGTGTCTAACCGTTCCAATGACCAGAGGCAACA  656

Query  600  AATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATA  673
            |||.||||||||.|||||||||...|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  657  AATCAAAGCAGCTTTTAAGACCATGTATGGCAAGGATTTAATTAAAGATCTCAAGTCAGAATTGAGTGGGAATA  730

Query  674  TGGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAG  747
            ||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  731  TGGAAGAATTAATCCTTGCGCTGTTCATGCCTTCTACATACTATGATGCCTGGAGCTTACGGAAGGCAATGCAG  804

Query  748  GGAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGT  821
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  805  GGAGCAGGAACTCAAGAACGTGTATTGATAGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAAGAAATTCGAGACATTGT  878

Query  822  CAGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAAC  895
            .||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  879  TAGATGTTACCAATTAGAATTTGGACGAGACCTTGAGAAGGACATTAGGTCAGATACCTCGGGACATTTTGAAC  952

Query  896  GTTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGAT  969
            ||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||..|||||..|.||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct  953  GTCTCCTCGTGTCCATGTGCCAGGGAAACCGTGACGAGAGGCAGAGCGTGAACCACCAGATGGCCCAGGAGGAC  1026

Query  970  GCTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCAC  1043
            |||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1027  GCTCAGCGTCTCTATCAGGCCGGGGAGGGGAGACTGGGAACGGATGAATCCTGTTTCAACATGATTCTCGCCAC  1100

Query 1044  AAGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTG  1117
            |||.|||||.||||||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 1101  AAGGAGCTTCCCTCAGCTGAAGGCCACTATGGAGGCTTATTCCAGGATGGCTAATCGCGATTTGCTAAGCAGTG  1174

Query 1118  TGAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCC  1191
            |.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1175  TAAGCCGAGAATTTTCGGGATACGTTGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGCGCCCTCAACCGCCCTGCC  1248

Query 1192  TTCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGT  1265
            |||||||||||..|.|||||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1249  TTCTTTGCTGAACGACTCTACTATTCCATGAAAGGCGCTGGCACGGACGACTCCACCCTGGTCAGGATTGTGGT  1322

Query 1266  CACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAA  1339
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||..||||||
Sbjct 1323  CACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTTCAGATAAAACAGATGTTCACCCAGATGTATCAGAAGACCCTAAGCACAA  1396

Query 1340  TGATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTAC-CGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1398
            ||||.|||.|||||||||||||||||||| .|||| ||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1397  TGATCGCAAGTGACACGAGTGGAGATTACAGGAAG-CTGCTCCTGGCCATCGTTGGCCAG  1455