Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00073
• Subject: XM_006717813.2
• Aligned Length: 1638
• Identities: 1498
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGAGCTACCCTGGCTATCCCCCGCCCCCAGGTGGCTACCCACCAGCTGCACCAGGTGGTGGTCCCTGGGGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCTACCCTGGCTATCCCCCGCCCCCAGGTGGCTACCCACCAGCTGCACCAGGTGGTGGTCCCTGGGGAGG  74

Query   75  TGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGGCAGTTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGGCAGTTCA  148

Query  149  ACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTAC  222

Query  223  CCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCTGCCCAGCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCTGCCCAGCAGCC  296

Query  297  TGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACC  370

Query  371  CAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACCCTGGGCAGCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACCCTGGGCAGCCA  444

Query  445  CCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATA  518

Query  519  CCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCATCACTGATGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCATCACTGATGCTC  592

Query  593  CCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGGATGAGCAGGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGGATGAGCAGGCC  666

Query  667  ATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGG  740

Query  741  CAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTCTGATGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTCTGATGAAGA  814

Query  815  CCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATT  888

Query  889  GAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAATTCAAAAAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAATTCAAAAAGAC  962

Query  963  CCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAGGGAAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAGGGAAACC  1036

Query 1037  GTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAAC  1110

Query 1111  CGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTGGTAGCAGTTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTGGTAGCAGTTTT  1184

Query 1185  CAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGG  1258

Query 1259  AGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATG  1332

Query 1333  AGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGACCTCCTGGACAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGACCTCCTGGACAT  1406

Query 1407  CAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATA--------CTTCAGG  1472
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||        ||.||||
Sbjct 1407  CAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGG----TACGGGCCTGCTGCAGG  1476

Query 1473  ------------------------------------GGATTACC---------GGA------AGAT--------  1487
                                                |||  |||         |||      |.||        
Sbjct 1477  CCAACTGGGCTCCCTTTTGGCATCTCAGTCACCTGTGGA--ACCTCCCTCCTTGGAGTGGCCATATGCTTGGCC  1548

Query 1488  --TCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCA-----AT----GAC-----------------------------------  1515
              |.|||||      ||||..||||     ||    |||                                   
Sbjct 1549  TCTGTGCTG------TGTGTGGGCATCTTGATTATGGACCTCGGACTTGTTCATCCCCTTGCCCTTAAACAGAT  1616

Query 1516  ----------  1515
                      
Sbjct 1617  TATAAATTTC  1626