Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00098
• Subject: NM_001369020.1
• Aligned Length: 966
• Identities: 711
• Gaps: 255

Alignment

Query   1  ATGAGCGCCAAGTCCAGAACCATAGGGATTATTGGAGCTCCTTTCTCAAAGGGACAGCCACGAGGAGGGGTGGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCGCCAAGTCCAGAACCATAGGGATTATTGGAGCTCCTTTCTCAAAGGGACAGCCACGAGGAGGGGTGGA  74

Query  75  AGAAGGCCCTACAGTATTGAGAAAGGCTGGTCTGCTTGAGAAACTTAAAGAACAAGAGTGTGATGTGAAGGATT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGAAGGCCCTACAGTATTGAGAAAGGCTGGTCTGCTTGAGAAACTTAAAGAACAAGAGTGTGATGTGAAGGATT  148

Query 149  ATGGGGACCTGCCCTTTGCTGACATCCCTAATGACAGTCCCTTTCAAATTGTGAAGAATCCAAGGTCTGTGGGA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATGGGGACCTGCCCTTTGCTGACATCCCTAATGACAGTCCCTTTCAAATTGTGAAGAATCCAAGGTCTGTGGGA  222

Query 223  AAAGCAAGCGAGCAGCTGGCTGGCAAGGTGGCAGAAGTCAAGAAGAACGGAAGAATCAGCCTGGTGCTGGGCGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAAGCAAGCGAGCAGCTGGCTGGCAAGGTGGCAGAAGTCAAGAAGAACGGAAGAATCAGCCTGGTGCTGGGCGG  296

Query 297  AGACCACAGTTTGGCAATTGGAAGCATCTCTGGCCATGCCAGGGTCCACCCTGATCTTGGAGTCATCTGGGTGG  370
           |||||||||                                                                 
Sbjct 297  AGACCACAG-----------------------------------------------------------------  305

Query 371  ATGCTCACACTGATATCAACACTCCACTGACAACCACAAGTGGAAACTTGCATGGACAACCTGTATCTTTCCTC  444
                                                                                     
Sbjct 306  --------------------------------------------------------------------------  305

Query 445  CTGAAGGAACTAAAAGGAAAGATTCCCGATGTGCCAGGATTCTCCTGGGTGACTCCCTGTATATCTGCCAAGGA  518
                                                                                     
Sbjct 306  --------------------------------------------------------------------------  305

Query 519  TATTGTGTATATTGGCTTGAGAGACGTGGACCCTGGGGAACACTACATTTTGAAAACTCTAGGCATTAAATACT  592
                                                     ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306  ------------------------------------------CTACATTTTGAAAACTCTAGGCATTAAATACT  337

Query 593  TTTCAATGACTGAAGTGGACAGACTAGGAATTGGCAAGGTGATGGAAGAAACACTCAGCTATCTACTAGGAAGA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338  TTTCAATGACTGAAGTGGACAGACTAGGAATTGGCAAGGTGATGGAAGAAACACTCAGCTATCTACTAGGAAGA  411

Query 667  AAGAAAAGGCCAATTCATCTAAGTTTTGATGTTGACGGACTGGACCCATCTTTCACACCAGCTACTGGCACACC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412  AAGAAAAGGCCAATTCATCTAAGTTTTGATGTTGACGGACTGGACCCATCTTTCACACCAGCTACTGGCACACC  485

Query 741  AGTCGTGGGAGGTCTGACATACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATCTACAAAACAGGGCTACTCTCAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486  AGTCGTGGGAGGTCTGACATACAGAGAAGGTCTCTACATCACAGAAGAAATCTACAAAACAGGGCTACTCTCAG  559

Query 815  GATTAGATATAATGGAAGTGAACCCATCCCTGGGGAAGACACCAGAAGAAGTAACTCGAACAGTGAACACAGCA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560  GATTAGATATAATGGAAGTGAACCCATCCCTGGGGAAGACACCAGAAGAAGTAACTCGAACAGTGAACACAGCA  633

Query 889  GTTGCAATAACCTTGGCTTGTTTCGGACTTGCTCGGGAGGGTAATCACAAGCCTATTGACTACCTTAACCCACC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634  GTTGCAATAACCTTGGCTTGTTTCGGACTTGCTCGGGAGGGTAATCACAAGCCTATTGACTACCTTAACCCACC  707

Query 963  TAAG  966
           ||||
Sbjct 708  TAAG  711