Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00106
- Subject:
- XM_011545034.2
- Aligned Length:
- 1347
- Identities:
- 1251
- Gaps:
- 93
Alignment
Query 1 -------------------------------------ATG---GGCG---ACAAA------------------- 12
||| |||| |||.|
Sbjct 1 ATGGAAGGAGACTTGCAGCGGGAGAGGCTGAGGTTACATGCCAGGCGCATACAGACGTTGGCCTTTCATCCCCC 74
Query 13 ---------GGGA----------------------CCCGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCA 55
.||| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAACACCCTGGAGCAGGCTGTGTTGCCCTATTATCCAGAGTGTTCAAGAAGGCCAGTCCAAATGGAAAGCTCA 148
Query 56 CCGTCTACCTGGGAAAGCGGGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTG 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGTCTACCTGGGAAAGCGGGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGGATGGTGTGGTCCTGGTG 222
Query 130 GATCCTGAGTATCTCAAAGAGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCT 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATCCTGAGTATCTCAAAGAGCGGAGAGTCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCT 296
Query 204 GGATGTCCTGGGCCTGACCTTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGG 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATGTCCTGGGCCTGACCTTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCGAGG 370
Query 278 ACAAGAAGCCCCTGACGCGGCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTT 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAAGAAGCCCCTGACGCGGCTGCAGGAACGCCTCATCAAGAAGCTGGGCGAGCACGCTTACCCTTTCACCTTT 444
Query 352 GAGATCCCTCCAAACCTTCCATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGT 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGATCCCTCCAAACCTTCCATGTTCTGTGACACTGCAGCCGGGGCCCGAAGACACGGGGAAGGCTTGCGGTGT 518
Query 426 GGACTATGAAGTCAAAGCCTTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACTATGAAGTCAAAGCCTTCTGCGCGGAGAATTTGGAGGAGAAGATCCACAAGCGGAATTCTGTGCGTCTGG 592
Query 500 TCATCCGGAAGGTTCAGTATGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTC 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCATCCGGAAGGTTCAGTATGCCCCAGAGAGGCCTGGCCCCCAGCCCACAGCCGAGACCACCAGGCAGTTCCTC 666
Query 574 ATGTCGGACAAGCCCTTGCACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGT 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGTCGGACAAGCCCTTGCACCTAGAAGCCTCTCTGGATAAGGAGATCTATTACCATGGAGAACCCATCAGCGT 740
Query 648 CAACGTCCACGTCACCAACAACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACGTCCACGTCACCAACAACACCAACAAGACGGTGAAGAAGATCAAGATCTCAGTGCGCCAGTATGCAGACA 814
Query 722 TCTGCCTTTTCAACACAGCTCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGC 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTGCCTTTTCAACACAGCTCAGTACAAGTGCCCTGTTGCCATGGAAGAGGCTGATGACACTGTGGCACCCAGC 888
Query 796 TCGACGTTCTGCAAGGTCTACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGA 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCGACGTTCTGCAAGGTCTACACACTGACCCCCTTCCTAGCCAATAACCGAGAGAAGCGGGGCCTCGCCTTGGA 962
Query 870 CGGGAAGCTCAAGCACGAAGACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCC 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGGGAAGCTCAAGCACGAAGACACGAACTTGGCCTCTAGCACCCTGTTGAGGGAAGGTGCCAACCGTGAGATCC 1036
Query 944 TGGGGATCATTGTTTCCTACAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCGGCCTGTTGGGAGATCTTGCA 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGGGATCATTGTTTCCTACAAAGTGAAAGTGAAGCTGGTGGTGTCTCGGGGCGGCCTGTTGGGAGATCTTGCA 1110
Query 1018 TCCAGCGACGTGGCCGTGGAACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGA 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCAGCGACGTGGCCGTGGAACTGCCCTTCACCCTAATGCACCCCAAGCCCAAAGAGGAACCCCCGCATCGGGA 1184
Query 1092 AGTTCCAGAGAACGAGACGCCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGTTCCAGAGAACGAGACGCCAGTAGATACCAATCTCATAGAACTTGACACAAATGATGACGACATTGTATTTG 1258
Query 1166 AGGACTTTGCTCGCCAGAGACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCA 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGACTTTGCTCGCCAGAGACTGAAAGGCATGAAGGATGACAAGGAGGAAGAGGAGGATGGTACCGGCTCTCCA 1332
Query 1240 CAGCTCAACAACAGA 1254
|||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCTCAACAACAGA 1347