Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00195
• Subject: NM_001003675.3
• Aligned Length: 878
• Identities: 722
• Gaps: 139

Alignment

Query   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACAGAGTGCAAATTCACCTGCACCAGTGGTAAATGCTT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTATCTTGGTTCGCTGGTCTGTAACCAACAGAACGACTGTGGGGACAACAGTGACGAAG-----------AGAA  137
                        .||..|.||.||||.|.||||.||       |..|||.|||.|.||           |||.
Sbjct   1  -------------ATGTCCAGTGACCACCTGAACAAC-------AGCACACTGAAGGAGGCTCAGTTCAAAGAC  54

Query 138  CTGTCTCCTGGTGACCGAGCACCCGCCTCCGGGCATCTT---CAACTCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCA  208
           ||||                               ||||   .||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  55  CTGT-------------------------------TCTTAAAAAAAGCGGAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCA  97

Query 209  TCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGG  282
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  98  TCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCTGAACCACTACAAAGTCTCCACGCGG  171

Query 283  TCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGCAGATCATGCATGCCCCGCGGTC  356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172  TCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGCCGCAGATCATGCATGCCCCGCGGTC  245

Query 357  CAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATG  430
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 246  CAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCCCTATG  319

Query 431  TGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCC  504
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320  TGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGGGGCCC  393

Query 505  TGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCG  578
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394  TGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCCAACCG  467

Query 579  AACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGG  652
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468  AACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAACTCGG  541

Query 653  GCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGC  726
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542  GCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGATGGGC  615

Query 727  CACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCA  800
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616  CACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTTCAGCA  689

Query 801  GAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  864
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690  GAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  753