Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00214
• Subject: NM_001198869.1
• Aligned Length: 2142
• Identities: 2142
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGCAGCGGGCCAGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGAGGAGATCATCACGCCGGTGTACTGCACTGGGGTGTCAGCCCAAGTGCAGAAGCAGCGGGCCAGGGA  74

Query   75  GCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTGCGGGTGCGATGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGGGCCTGGGCCGCCATGAGAATGCCATCAAGTACCTGGGCCAGGATTATGAGCAGCTGCGGGTGCGATGCC  148

Query  149  TGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTACAAGGACCTGGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCAGAGTGGGACCCTCTTCCGTGATGAGGCCTTCCCCCCGGTACCCCAGAGCCTGGGTTACAAGGACCTGGGT  222

Query  223  CCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCACGGAACTGCTGTCAAACCCCCAGTTCATTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAATTCCTCCAAGACCTATGGCATCAAGTGGAAGCGTCCCACGGAACTGCTGTCAAACCCCCAGTTCATTGT  296

Query  297  GGATGGAGCTACCCGCACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGCTGGCTCTTGGCGGCCATCGCCTCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATGGAGCTACCCGCACAGACATCTGCCAGGGAGCACTGGGGGACTGCTGGCTCTTGGCGGCCATCGCCTCCC  370

Query  371  TCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGGCTATGCCGGCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACTCTCAACGACACCCTCCTGCACCGAGTGGTTCCGCACGGCCAGAGCTTCCAGAATGGCTATGCCGGCATC  444

Query  445  TTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGCCCATCAAGGACGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCCATTTCCAGCTGTGGCAATTTGGGGAGTGGGTGGACGTGGTCGTGGATGACCTGCTGCCCATCAAGGACGG  518

Query  519  GAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAGGCCTATGCCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGCTAGTGTTCGTGCACTCTGCCGAAGGCAACGAGTTCTGGAGCGCCCTGCTTGAGAAGGCCTATGCCAAGG  592

Query  593  TAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCACAGGCGGGGTTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAATGGCAGCTACGAGGCCCTGTCAGGGGGCAGCACCTCAGAGGGCTTTGAGGACTTCACAGGCGGGGTTACC  666

Query  667  GAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGGAGCGGGGCTCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTGGTACGAGTTGCGCAAGGCTCCCAGTGACCTCTACCAGATCATCCTCAAGGCGCTGGAGCGGGGCTCCCT  740

Query  741  GCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAGTTGGTGAAGGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGGGCTGCTCCATAGACATCTCCAGCGTTCTAGACATGGAGGCCATCACTTTCAAGAAGTTGGTGAAGGGCC  814

Query  815  ATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGATCCGGATGCGGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCCTACTCTGTGACCGGGGCCAAGCAGGTGAACTACCGAGGCCAGGTGGTGAGCCTGATCCGGATGCGGAAC  888

Query  889  CCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACGTGGACCCATATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCTGGGGCGAGGTGGAGTGGACGGGAGCCTGGAGCGACAGCTCCTCAGAGTGGAACAACGTGGACCCATATGA  962

Query  963  ACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTCATGCGGGAGTTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACGGGACCAGCTCCGGGTCAAGATGGAGGACGGGGAGTTCTGGATGTCATTCCGAGACTTCATGCGGGAGTTCA  1036

Query 1037  CCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATGGAACACCACACTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCGCCTGGAGATCTGCAACCTCACACCCGACGCCCTCAAGAGCCGGACCATCCGCAAATGGAACACCACACTC  1110

Query 1111  TACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCTTCTGGGTGAACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACGAAGGCACCTGGCGGCGGGGGAGCACCGCGGGGGGCTGCCGAAACTACCCAGCCACCTTCTGGGTGAACCC  1184

Query 1185  TCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCAGGCTGCAGCTTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGTTCAAGATCCGGCTGGATGAGACGGATGACCCGGACGACTACGGGGACCGCGAGTCAGGCTGCAGCTTCG  1258

Query 1259  TGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGACTATTGGCTTCGCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTCGCCCTTATGCAGAAGCACCGTCGCCGCGAGCGCCGCTTCGGCCGCGACATGGAGACTATTGGCTTCGCG  1332

Query 1333  GTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCTTCCTGGCCAATGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCTACGAGGTCCCTCCGGAGCTGGTGGGCCAGCCGGCCGTACACTTGAAGCGTGACTTCTTCCTGGCCAATGC  1406

Query 1407  GTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTGCCACCCGGGGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCTCGGGCGCGCTCAGAGCAGTTCATCAACCTGCGAGAGGTCAGCACCCGCTTCCGCCTGCCACCCGGGGAGT  1480

Query 1481  ATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTTCTCAGAGAAGAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTGGTGGTGCCCTCCACCTTCGAGCCCAACAAGGAGGGCGACTTCGTGCTGCGCTTCTTCTCAGAGAAGAGT  1554

Query 1555  GCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCTCAGAAGAGGAGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGGGACTGTGGAGCTGGATGACCAGATCCAGGCCAATCTCCCCGATGAGCAAGTGCTCTCAGAAGAGGAGAT  1628

Query 1629  TGACGAGAACTTCAAGGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTGAAGGAGTTGCGGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGACGAGAACTTCAAGGCCCTCTTCAGGCAGCTGGCAGGGGAGGACATGGAGATCAGCGTGAAGGAGTTGCGGA  1702

Query 1703  CAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGAGTCGTGCCGCAGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAATCCTCAATAGGATCATCAGCAAACACAAAGACCTGCGGACCAAGGGCTTCAGCCTAGAGTCGTGCCGCAGC  1776

Query 1777  ATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCCTGTGGAACCGCAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGGTGAACCTCATGGATCGTGATGGCAATGGGAAGCTGGGCCTGGTGGAGTTCAACATCCTGTGGAACCGCAT  1850

Query 1851  CCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCCTACGAGATGCGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGGAATTACCTGTCCATCTTCCGGAAGTTTGACCTGGACAAGTCGGGCAGCATGAGTGCCTACGAGATGCGGA  1924

Query 1925  TGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCGCTACTCGGAGCCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGCCATTGAGTCGGCAGGCTTCAAGCTCAACAAGAAGCTGTACGAGCTCATCATCACCCGCTACTCGGAGCCC  1998

Query 1999  GACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCCGATTTTTCAAAAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACCTGGCGGTCGACTTTGACAATTTCGTTTGCTGCCTGGTGCGGCTAGAGACCATGTTCCGATTTTTCAAAAC  2072

Query 2073  TCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACCATGTTTGCA  2142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCTGGACACAGATCTGGATGGAGTTGTGACCTTTGACTTGTTTAAGTGGTTGCAGCTGACCATGTTTGCA  2142