Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00218
• Subject: XM_006538504.3
• Aligned Length: 932
• Identities: 730
• Gaps: 130

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGCATCCTAGCAGGCGCAGCCTTCCTTTCCCCCTGAACTGTCAGCTTGTTAGAGTTGGGACTGCTGATTATGG  74

Query   1  --------------ATGAGTGATCAGCAGCTGGACTGTGCCTTGGACCTAATGAGGCGCCTGCCTCCCCAGCAA  60
                         | |||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  75  AGGTGCCTCGGAGCA-GAGCGATCAGCAGCTGGACTGCGCCTTGGACCTGATGAGGCGCCTGCCTCCACAGCAG  147

Query  61  ATCGAGAAAAACCTCAGCGACCTGATCGACCTGGTCCCCAGTCTATGTGAGGATCTCCTGTCTTCTGTTGACCA  134
           ||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 148  ATTGAGAAGAACCTCAGCGATCTGATCGACCTGGTCCCCAGTCTGTGTGAAGATCTCCTGTCATCTGTTGACCA  221

Query 135  GCCACTGAAAATTGCCAGAGACAAGGTGGTGGGAAAGGATTACCTTTTGTGTGACTACAACAGAGATGGGGACT  208
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 222  GCCCCTGAAAATTGCCAGAGACAAGGTGGTGGGCAAGGATTACCTTTTGTGTGACTACAACAGAGACGGGGACT  295

Query 209  CCTATAGGTCACCATGGAGTAACAAGTATGACCCTCCCTTGGAGGATGGGGCCATGCCGTCAGCTCGGCTGAGA  282
           |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 296  CCTATAGGTCACCGTGGAGTAACAAGTATGACCCTCCTTTGGAAGATGGGGCCATGCCATCTGCTCGGCTCAGA  369

Query 283  AAGCTGGAGGTGGAAGCCAACAATGCCTTTGACCAGTATCGAGACCTGTATTTTGAAGGTGGCGTCTCATCTGT  356
           |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 370  AAGCTGGAGGTAGAGGCCAACAATGCCTTCGACCAATACCGAGACCTGTATTTTGAAGGTGGGGTCTCATCAGT  443

Query 357  CTACCTCTGGGATCTGGATCATGGCTTTGCTGGAGTGATCCTCATAAAGAAGGCTGGAGATGGATCAAAGAAGA  430
           |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 444  CTACCTCTGGGATCTTGATCATGGCTTTGCTGGAGTGATCCTCATAAAGAAAGCTGGAGATGGATCCAAGAAGA  517

Query 431  TCAAAGGCTGCTGGGATTCCATCCACGTGGTAGAAGTGCAGGAGAAATCCAGCGGTCGCACCGCCCATTACAAG  504
           |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 518  TCAAAGGCTGCTGGGATTCCATCCACGTGGTGGAAGTGCAGGAGAAGTCCAGCGGCCGTACTGCCCATTACAAG  591

Query 505  TTGACCTCCACGGTGATGCTGTGGCTGCAGACCAACAAATCTGGCTCTGGCACCATGAACCTCGGAGGCAGCCT  578
           ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 592  TTGACCTCCACGGTGATGCTATGGCTGCAAACCAACAAATCCGGCTCGGGCACCATGAACCTGGGAGGCAGCCT  665

Query 579  TACCAGACAGATGGAGAAGGATGAAACTGTGAGTGACTGCTCCCCACACATAGCCAACATCGGGCGCCTGGTAG  652
           .|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666  AACCAGACAGATGGAGAAAGACGAAACTGTGAGTGACTGTTCCCCACACATAGCCAACATCGGGCGCCTGGTGG  739

Query 653  AGGACATGGAAAATAAAATCAGAAGTACGCTGAACGAGATCTACTTTGGAAAAACAAAGGATATCGTCAATGGG  726
           |||||||||||||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 740  AGGACATGGAAAACAAAATCCGAAGCACGCTGAATGAGATCTACTTTGGAAAAACAAAGGACATCGTCAACGGG  813

Query 727  CTGAGGTCTGTGCAGACTTTTGCAGACAAATCAAAACAAG---AAGC--TCTGAAGAATGACCT------GGTG  789
           |||||.|||.|..|..||.|..|.||||    |..|||||   ||||  | ||.|||..||.||      .|||
Sbjct 814  CTGAGATCTCTTGATGCTATCCCCGACA----ACCACAAGTTTAAGCAGT-TGCAGAGGGAACTTTCTCAAGTG  882

Query 790  GAGGCTTTGA---AGAGAAAG---------CAGC-----AATGC  816
                 .|||   ||.|..||         ||||     |||  
Sbjct 883  ------CTGACCCAGCGCCAGGTCTACATCCAGCCTGATAAT--  918