Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00229
• Subject: NM_001001890.3
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1354
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAAT  74
                                                                       ||||.||        
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------ATGCGTA--------  7

Query   75  GAATCCTTCTAGAGACGTCCAC---GATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCC  145
                             |||.|   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    8  -----------------TCCCCGTAGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAGCC  64

Query  146  CAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  CAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGC  138

Query  220  GGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCT  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  GGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTCCT  212

Query  294  CTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  CTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGGG  286

Query  368  ATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  ATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCT  360

Query  442  ACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  ACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAG  434

Query  516  CTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  CTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCACAG  508

Query  590  TGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  TGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCTTT  582

Query  664  TCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCAC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  TCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCAC  656

Query  738  GCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATACAA  730

Query  812  GGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  GGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCT  804

Query  886  GTGCACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GTGCACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGTCG  878

Query  960  ACTCTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  ACTCTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACC  952

Query 1034  CCCGCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  CCCGCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGTCG  1026

Query 1108  GCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  GCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGG  1100

Query 1182  CCCGTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CCCGTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCATGG  1174

Query 1256  TGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAAC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  TGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAAC  1248

Query 1330  CCCAGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CCCAGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCGCC  1322

Query 1404  CTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1440
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Sbjct 1323  CTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1359