Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00241
• Subject: NM_006584.4
• Aligned Length: 1601
• Identities: 1290
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGTGAAGACCCTGAACCCCAAGGCCGAGGTGGCCCGAGCGCAGGCGGCGCTGGCGGTCAACATCAG  74
            |||||.|||.|.|||.||.|.|||.|||||||.||||||||.||.||.|.|||.||..||||.|||||.||..|
Sbjct    1  ATGGCTGCGATAAAGGCCGTCAACTCCAAGGCTGAGGTGGCGCGGGCCCGGGCAGCTTTGGCTGTCAATATATG  74

Query   75  CGCAGCGCGGGGTCTGCAGGACGTGCTAAGGACCAACCTGGGGCCCAAGGGCACCATGAAGATGCTCGTTTCTG  148
            |||.||.||.||.||||||||.|||||..||||||||.||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct   75  CGCCGCCCGAGGGCTGCAGGATGTGCTGCGGACCAACTTGGGTCCTAAAGGCACCATGAAAATGCTTGTTTCTG  148

Query  149  GCGCTGGAGACATCAAACTTACTAAAGACGGCAATGTGCTGCTTCACGAAATGCAAATTCAACACCCAACAGCT  222
            |.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||..|.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  GTGCAGGTGACATCAAACTCACCAAAGATGGCAATGTGCTGCTCGATGAGATGCAAATTCAACATCCAACAGCT  222

Query  223  TCCTTAATAGCAAAGGTAGCAACAGCCCAGGATGATATAACTGGTGATGGTACGACTTCTAATGTCCTAATCAT  296
            |||||.||||||||.|||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct  223  TCCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTAT  296

Query  297  TGGAGAGCTGCTGAAACAGGCGGATCTCTACATTTCTGAAGGCCTTCATCCTAGAATAATCACTGAAGGATTTG  370
            |||||||.|..|.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTG  370

Query  371  AAGCTGCAAAGGAAAAGGCCCTTCAGTTTTTGGAAGAAGTCAAAGTAAGCAGA-GAGATGGACAGGGAAACACT  443
            |||||||||||..|||.||.|||.|..|||||||.|||||.|||||.| ||.| ||||||.|.||..|||..||
Sbjct  371  AAGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGA-CAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCT  443

Query  444  TATAGATGTGGCCAGAACATCTCTTCGTACTAAAGTTCATGCTGAACTTGCAGATGTCTTAACAGAGGCTGTAG  517
            ..|||||||.||.||||||||..|.|..||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  444  CTTAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGG  517

Query  518  TGGACTCCATTTTGGCCATTAAAAAGCAAGATGAACCTATTGATCTCTTCATGATTGAGATCATGGAGATGAAA  591
            ||||.||..|||||||..|||.||..|.||.|.|.||||||||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.
Sbjct  518  TGGATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAG  591

Query  592  CATAAATCTGAAACTGATACAAGCTTAATCAGAGGGCTTGTTTTGGACCACGGAGCACGGCATCCTGATATGAA  665
            |||||||..|.|||.|||||||..||.|||..|||..|.||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct  592  CATAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAA  665

Query  666  GAAAAGGGTGGAGGATGCATACATCCTCACTTGTAACGTGTCATTAGAGTATGAGAAAACAGAAGTGAATTCTG  739
            |||..|.||.||.|||||||..|||||.|.|||.|||||.|||.|.||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  666  GAAGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTG  739

Query  740  GCTTTTTTTACAAGAGTGCAGAAGAGAGAGAAAAACTCGTGAAAGCTGAAAGAAAATTCATTGAAGATAGGGTT  813
            |.||.|||||.||||.|||||||||||.|||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  740  GTTTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTA  813

Query  814  AAAAAAATAATAGAACTGAAAAGG--AAAGTCTGTGGCGATTCAGATAAAGGATTTGTTGTTATTAATCAAAAG  885
            .|||||||||||||.|||  ||||  ||||||||||...|.|||.|||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  814  CAAAAAATAATAGACCTG--AAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAG  885

Query  886  GGAATTGACCCCTTTTCCTTAGATGCTCTTTCAAAAGAAGGCATAGTTGCTCTGCGCAGAGCTAAAAGGAGAAA  959
            ||||||||.||.||||||||||||.|||||.|||||.|.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  886  GGAATTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAA  959

Query  960  TATGGAGAGGCTGACTCTTGCTTGTGGTGGGGTAGCCCTGAATTCTTTTGACGACCTAAGTCCTGACTGCTTGG  1033
            ||||||.||.||..||||||||||||||||..|.|||.|||||||||||||.||.||.|.|...||.|||||||
Sbjct  960  TATGGAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGG  1033

Query 1034  GACATGCAGGACTTGTATATGAGTATACATTGGGAGAAGAGAAGTTTACCTTTATTGAGAAATGTAACAACCCT  1107
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||...||||||
Sbjct 1034  GACATGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCT  1107

Query 1108  CGTTCTGTCACATTATTGATCAAAGGACCAAATAAGCACACACTCACTCAGATCAAAGATGC----AGTGAGGG  1177
            .|.|||||.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.|||||.||..||||.|||||    ||.||.||
Sbjct 1108  TGCTCTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGG  1181

Query 1178  ACGGCTTGAGGGCTGTCAAAAATGCTATTGATGATGGCTGTGTGGTTCCAGGTGCTGGTGCCGTGGAAGTGGCA  1251
            ||    |..|.|||.||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||..|.|||||||||
Sbjct 1182  AC----TTCGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCA  1251

Query 1252  ATGGCAGAAGCCCTGATTAAACATAAGCCCAGTGTAAAGGGCAGGGCACAGCTTGGAGTCCAAGCATTTGCTGA  1325
            |||||.|||||.||..|||.|.|||||..||||.||||.||.||.||.|..||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1252  ATGGCTGAAGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGA  1325

Query 1326  TGCATTGCTCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAACTCTGGTTTTGACCTTCAGGAAACATTAGTTAAAATTC  1399
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||||.|||||..||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1326  TGCCTTACTCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTC  1399

Query 1400  AAGCAGAACAT-TCAGAATCAGGTCAGCTTGTGGGTGTGGACCTGAACACAGGTGAGCCAATGGTGGCAGCAGA  1472
            |.||.||.||| || ||.|||...||.||||||||.||.||..||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1400  AGGCTGAGCATGTC-GAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGA  1472

Query 1473  AGTAGGCGTATGGGATAACTATTGTGTAAAGAAACAGCTTCTTCACTCCTGCACTGTGATTGCCACCAACATTC  1546
            .|.|||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TGCAGGAGTTTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTC  1546

Query 1547  TCTTGGTTGATGAGATCATGCGAGCTGGAATGTCTTCTCTGAAAGGT  1593
            ||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||   
Sbjct 1547  TCCTGGTTGATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA---  1590