Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00275
- Subject:
- NM_001204744.2
- Aligned Length:
- 2487
- Identities:
- 2421
- Gaps:
- 66
Alignment
Query 1 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT 74
Query 75 GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG 148
Query 149 GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT 222
Query 223 TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA 296
Query 297 GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC 370
Query 371 CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT 444
Query 445 GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC 518
Query 519 CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA 592
Query 593 GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC 666
Query 667 CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC 740
Query 741 AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC 814
Query 815 TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA 888
Query 889 GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA 962
Query 963 GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC 1036
Query 1037 CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT 1110
Query 1111 TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC 1184
Query 1185 CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA 1258
Query 1259 TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT 1332
Query 1333 CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT 1406
Query 1407 GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG 1480
Query 1481 ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC 1554
Query 1555 AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC 1628
Query 1629 AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA 1702
Query 1703 GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC 1776
Query 1777 AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT 1850
Query 1851 GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATA--- 1921
Query 1925 ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT 1998
|||||||||||
Sbjct 1922 ---------------------------------------------------------------CAGCCCTGACT 1932
Query 1999 CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA 2006
Query 2073 GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007 GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT 2080
Query 2147 GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC 2154
Query 2221 ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA 2228
Query 2295 CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229 CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC 2302
Query 2369 TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303 TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG 2376
Query 2443 GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC 2487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC 2421