Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00275
• Subject: NM_001204745.2
• Aligned Length: 2487
• Identities: 2370
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT  74

Query   75  GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG  148

Query  149  GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT  222

Query  223  TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA  296

Query  297  GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC  370

Query  371  CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT  444

Query  445  GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC  518

Query  519  CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA  592

Query  593  GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC  666

Query  667  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  740

Query  741  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  814

Query  815  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  888

Query  889  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  962

Query  963  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  1036

Query 1037  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  1110

Query 1111  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  1184

Query 1185  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  1258

Query 1259  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  1332

Query 1333  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  1406

Query 1407  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  1480

Query 1481  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1554

Query 1555  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1628

Query 1629  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1702

Query 1703  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1776

Query 1777  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1850

Query 1851  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1851  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATAC--  1922

Query 1925  ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT  1998
                                                                                      
Sbjct 1923  --------------------------------------------------------------------------  1922

Query 1999  CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  2072
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923  -----------------------------------------AGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  1955

Query 2073  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  2029

Query 2147  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  2103

Query 2221  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  2177

Query 2295  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  2251

Query 2369  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  2325

Query 2443  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  2487
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2326  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  2370