Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00275
- Subject:
- XM_011522807.2
- Aligned Length:
- 2487
- Identities:
- 2298
- Gaps:
- 189
Alignment
Query 1 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT 74
Query 75 GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG 148
Query 149 GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT 222
Query 223 TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA 296
Query 297 GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC 370
Query 371 CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT 444
Query 445 GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC 518
Query 519 CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA 592
Query 593 GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC 666
Query 667 CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC 740
Query 741 AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC 814
Query 815 TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA 888
Query 889 GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA 962
Query 963 GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC 1036
Query 1037 CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT 1110
Query 1111 TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC 1184
Query 1185 CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA 1258
Query 1259 TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT 1332
Query 1333 CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT 1406
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCC------------------------------------------------- 1357
Query 1407 GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG 1480
Sbjct 1358 -------------------------------------------------------------------------- 1357
Query 1481 ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC 1554
||||||||
Sbjct 1358 ------------------------------------------------------------------AGAACCTC 1365
Query 1555 AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC 1439
Query 1629 AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA 1513
Query 1703 GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC 1587
Query 1777 AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT 1661
Query 1851 GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG 1735
Query 1925 ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT 1809
Query 1999 CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA 1883
Query 2073 GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884 GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT 1957
Query 2147 GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1958 GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC 2031
Query 2221 ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA 2105
Query 2295 CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC 2179
Query 2369 TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG 2253
Query 2443 GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC 2487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC 2298