Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00303
• Subject: XM_006498558.2
• Aligned Length: 1701
• Identities: 1166
• Gaps: 438

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGGCGCGCTCTGGCAAGATGGCGTCGGCGAGGTCGCGGGGTGCGCGGTGAGCGCCGGCCGCCGTCGCTCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCGGCCGGTCGCGCCTCAGGTCCGCCCGCCCGCGCGCGCCCCGCGGGCCCATGGCGGCGACAGGTGCGGGCGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGGCGGCTTGCCGGGCTGCCGCGGGCCGGGCGCGCCCCTCGCTAACGCGCGCGTAACTTTTCCTCGCTGCGGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCCCCGCGGCCTCCGCGCCACGCCCCCCGGGCCGCCGCCCCGCCGAGGTGCCGTCTGCCGGCCGCCGCGGGAGC  296

Query    1  ----------------------------ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTT  46
                                        |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGGAGCGCTGGGCGGCGCGGCTCCACCATGGCTCTGACCCTGTTCGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTT  370

Query   47  GGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACAGGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAA  120
            ||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  371  GGAAATCTTACTTATACCAGCTGCAGCAGGAAGCCCCTCACCCTCGAAGGGTCACCTGCACTTGTGAGGTAGAA  444

Query  121  AACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTGATTGT  194
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  445  AACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGA------------------------------------------------  470

Query  195  GGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAA  268
                                                                              ||||||||
Sbjct  471  ------------------------------------------------------------------ATTTGGAA  478

Query  269  GTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCAC  342
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  GTCAGACCAGAAACTTCAGGCTGTACTACGATGGAAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCAC  552

Query  343  GATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGAT  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  GATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGAT  626

Query  417  AAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTCC  490
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||.||||||
Sbjct  627  AAACCCAATTTATGAGCACATAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAACAGCACATGGCAGTCC  700

Query  491  TGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTT  564
            |||||||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TGAAAGAGACACATGATGAGAAAGAGGCTACAGGCCAGGATGGGGTATCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTT  774

Query  565  AGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATT  638
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  775  AGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAATGAACAAATTCCAAAATATGAAAAGGTTCACAATTTCAAGGTGCATACGTT  848

Query  639  CAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAG  712
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  CCGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTCATGTGGGGCCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAG  922

Query  713  ATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTC  786
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.
Sbjct  923  ATTGTGGGTTGAATGTTCACAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCCAATGACTGTAAGCCAGATCTGAAGCACGTG  996

Query  787  AAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACAT  860
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  AAGAAGGTGTACAGCTGTGACCTGACAACGCTCGTGAAAGCTCACATCACCAAGCGGCCAATGGTGGTAGACAT  1070

Query  861  GTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAA  934
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1071  GTGCATCAGGGAGATCGAGTCCAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTCTACCGAGTGTCAGGATTTAGTGACCTGA  1144

Query  935  TTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATC  1008
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1145  TTGAAGATGTCAAGATGGCTTTTGATAGAGATGGTGAGAAGGCGGATATTTCTGTGAACATGTATGAGGACATC  1218

Query 1009  AACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCC  1082
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1219  AACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATCTGCCAATTCCTCTCATCACATACGATGCCTACCC  1292

Query 1083  TAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTAC  1156
            .|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|...|
Sbjct 1293  CAAGTTCATTGAGTCTGCCAAAATTATGGACCCTGACGAGCAATTGGAGACCCTTCACGAAGCACTGAGATCGC  1366

Query 1157  TGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAG  1230
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1367  TGCCGCCTGCCCACTGCGAGACGCTCCGGTACCTCATGGCGCATCTCAAGAGAGTGACCCTTCATGAGAAGGAG  1440

Query 1231  AATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCAT  1304
            |||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.||||
Sbjct 1441  AATCTGATGAGTGCAGAGAACCTTGGGATCGTGTTTGGACCAACCCTCATGAGATCCCCAGAGCTCGACCCCAT  1514

Query 1305  GGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1377
            |||.||..||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515  GGCCGCCCTGAACGACATACGCTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1587