Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00309
• Subject: NM_009602.4
• Aligned Length: 1507
• Identities: 1320
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGCGCTGCGGCCCCGTGGCGCTGCTCCTTGGCTTCGGCCTCCTCCGGCTGTGCTCAGGGGTGTGGGG  74
            |||||||||.|||.|..|.|..||||||||||..|..||||.||||||||..|||||||.||||||||.|.|||
Sbjct    1  ATGGCCCGGTGCTCCAACTCTATGGCGCTGCTGTTCAGCTTTGGCCTCCTTTGGCTGTGTTCAGGGGTTTTGGG  74

Query   75  TACGGATACAGAGGAGCGGCTGGTGGAGCATCTCCTGGATCCTTCCCGCTACAACAAGCTTATCCGCCCAGCCA  148
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  TACTGACACAGAGGAGCGGCTGGTGGAGCATCTCTTGGATCCTTCCCGCTATAACAAGCTGATCCGTCCAGCTA  148

Query  149  CCAATGGCTCTGAGCTGGTGACAGTACAGCTTATGGTGTCACTGGCCCAGCTCATCAGTGTGCATGAGCGGGAG  222
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CTAATGGCTCTGAGCTGGTGACTGTACAGCTCATGGTATCATTGGCACAGCTCATCAGTGTGCACGAGCGGGAG  222

Query  223  CAGATCATGACCACCAATGTCTGGCTGACCCAGGAGTGGGAAGATTATCGCCTCACCTGGAAGCCTGAAGAGTT  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  223  CAGATCATGACCACCAACGTCTGGCTGACCCAGGAGTGGGAAGATTATCGCCTCACATGGAAGCCTGAGGATTT  296

Query  297  TGACAACATGAAGAAAGTTCGGCTCCCTTCCAAACACATCTGGCTCCCAGATGTGGTCCTGTACAACAATGCTG  370
            .|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  CGACAATATGAAGAAAGTCCGACTCCCTTCTAAGCACATCTGGCTCCCAGATGTGGTTCTATACAACAATGCTG  370

Query  371  ACGGCATGTACGAGGTGTCCTTCTATTCCAATGCCGTGGTCTCCTATGATGGCAGCATCTTCTGGCTGCCGCCT  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  ACGGCATGTACGAAGTCTCCTTCTATTCCAATGCTGTGGTCTCCTATGATGGCAGCATCTTTTGGCTACCGCCT  444

Query  445  GCCATCTACAAGAGCGCATGCAAGATTGAAGTAAAGCACTTCCCATTTGACCAGCAGAACTGCACCATGAAGTT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCATCTACAAGAGCGCATGCAAGATTGAGGTGAAGCACTTCCCATTTGACCAGCAGAACTGCACCATGAAGTT  518

Query  519  CCGTTCGTGGACCTACGACCGCACAGAGATCGACTTGGTGCTGAAGAGTGAGGTGGCCAGCCTGGACGACTTCA  592
            |||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGCTCCTGGACCTACGACCGCACTGAGATTGACCTGGTGCTCAAAAGCGATGTGGCCAGCCTGGACGACTTCA  592

Query  593  CACCTAGTGGTGAGTGGGACATCGTGGCGCTGCCGGGCCGGCGCAACGAGAACCCCGACGACTCTACGTACGTG  666
            ||||||||||.||||||||||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct  593  CACCTAGTGGGGAGTGGGACATCATCGCACTGCCAGGCCGACGCAACGAGAACCCAGACGACTCCACCTACGTG  666

Query  667  GACATCACGTATGACTTCATCATTCGCCGCAAGCCGCTCTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGTGTGCT  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  GACATCACCTACGACTTCATCATTCGTCGCAAACCGCTCTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTACT  740

Query  741  CATCACCTCGCTAGCCATCCTTGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGTGGCGAGAAGATGACGTTGTGCATCTCAG  814
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||..|.||.||.||.|
Sbjct  741  CATCACCTCGCTGGCCATCCTGGTCTTCTACCTGCCCTCAGACTGTGGTGAAAAGATGACACTTTGTATTTCTG  814

Query  815  TGCTGCTGGCGCTCACGGTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCTCCCACCTCCCTCGACGTGCCGCTC  888
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  TGCTGCTGGCGCTCACGGTGTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATTGTGCCTCCCACCTCCCTCGACGTACCGCTG  888

Query  889  GTCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTTGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTGTGCGTGCTCAACGT  962
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  GTGGGAAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTAGTCACCTTCTCCATCGTCACTAGCGTGTGTGTGCTCAATGT  962

Query  963  GCACCACCGCTCGCCCACCACGCACACCATGGCGCCCTGGGTGAAGGTCGTCTTCCTGGAGAAGCTGCCCGCGC  1036
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct  963  GCACCACCGTTCGCCTACCACGCACACCATGGCGCCCTGGGTCAAGGTGGTCTTCCTGGAGAAGCTGCCCACCC  1036

Query 1037  TGCTCTTCATGCAGCAGCCACGCCATCATTGCGCCCGTCAGCGCCTGCGCCTGCGGCGACGCCAGCGTGAGCGC  1110
            |.||||||.||||||||||||||||.|..||.||.|||||.|||||||||.||||..|.||||||||.||.||.
Sbjct 1037  TCCTCTTCCTGCAGCAGCCACGCCACCGCTGTGCACGTCAACGCCTGCGCTTGCGAAGGCGCCAGCGGGAACGT  1110

Query 1111  GAGGGCGCTGGAGCCCTCTTCTTCCGCGAAGCCCCAGGGGCCGACTCCTGCACGTGCTTCGTCAACCGCGCGTC  1184
            |||||.||.||..|.||.|||||||||||||..||.|..||.|||.|.||.||.|||||.|||||.|..||.||
Sbjct 1111  GAGGGGGCAGGCACACTATTCTTCCGCGAAGGTCCTGCAGCTGACCCATGTACCTGCTTTGTCAATCCTGCATC  1184

Query 1185  GGTGCAGGGGTTGGCCGGGGCCTTCGGGGCTGAGCCTGCACCAGTGGCGGGCCCCGGGCGCTC-AGGGGAGCCG  1257
            ..|||||||.|||||.|||||.|||..|||||||||.||..||   ||.||.|..|||||||| |.||| .||.
Sbjct 1185  AATGCAGGGCTTGGCTGGGGCTTTCCAGGCTGAGCCCGCTGCA---GCCGGTCTGGGGCGCTCGATGGG-CCCA  1254

Query 1258  TGTGGCTGTGGCCTCCGGGAGGCGGTGGACGGCGTGCGCTTCATCGCAGACCACATGCGGAGCGAGGACGATGA  1331
            ||..||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1255  TGCAGCTGTGGCCTCCGGGAAGCTGTGGACGGTGTACGCTTCATTGCGGACCATATGCGAAGTGAAGATGATGA  1328

Query 1332  CCAGAGCGTGAGTGAGGACTGGAAGTACGTCGCCATGGTGATCGACCGCCTCTTCCTCTGGATCTTTGTCTTTG  1405
            ||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  CCAGAGTGTGAGGGAGGATTGGAAATACGTTGCCATGGTGATCGACCGCCTGTTCCTCTGGATCTTTGTCTTTG  1402

Query 1406  TCTGTGTCTTTGGCACCATCGGCATGTTCCTGCAGCCTCTCTTCCAGAACTACACCACCACCACCTTCCTCCAC  1479
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||.|||
Sbjct 1403  TCTGTGTCTTTGGGACCATTGGCATGTTCCTGCAGCCTCTCTTCCAGAACTACACTGCCACGACCTTCCTTCAC  1476

Query 1480  TCAGACCACTCAGCCCCCAGCTCCAAG  1506
            ||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1477  TCTGACCACTCAGCTCCCAGCTCCAAG  1503