Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00310
• Subject: XM_011521187.2
• Aligned Length: 1517
• Identities: 1456
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGC--------------------  54
                              .|||.|           |||.|   |||||.|||.|                    
Sbjct    1  ------------------ATGGGC-----------GGTAG---TTTGCTGGCCCCAGCTCCAGATCATATTGTA  42

Query   55  ---GGGAACTGCCGCGTGGCCAATGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAA  125
               .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  TTATGGAACTGCCGCGTGGCCAATGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAA  116

Query  126  CCTGATCCGCCCAGCCACCAGCTCCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCA  199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  CCTGATCCGCCCAGCCACCAGCTCCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCA  190

Query  200  GCGTGAATGAGCGAGAGCAGATCATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACC  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  GCGTGAATGAGCGAGAGCAGATCATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACC  264

Query  274  TGGAACAGCTCCCGCTACGAGGGTGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGT  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  TGGAACAGCTCCCGCTACGAGGGTGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGT  338

Query  348  GCTTTACAACAACGCCGACGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCG  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  GCTTTACAACAACGCCGACGGGACCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCG  412

Query  422  TCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATCTACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAG  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  TCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATCTACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAG  486

Query  496  AACTGCACCCTCAAGTTCCGCTCCTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGC  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  AACTGCACCCTCAAGTTCCGCTCCTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGC  560

Query  570  CAGCATGGATGACTTTACTCCCAGTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCAC  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  CAGCATGGATGACTTTACTCCCAGTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCAC  634

Query  644  AAGACCCCAGCTACGTGGACGTGACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTC  717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  AAGACCCCAGCTACGTGGACGTGACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTC  708

Query  718  ATCATCCCCTGCGTGCTCACCACCTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGAT  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  ATCATCCCCTGCGTGCTCACCACCTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGAT  782

Query  792  GACACTGTGCATCTCAGTGCTGCTGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCT  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GACACTGTGCATCTCAGTGCTGCTGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCT  856

Query  866  CCCTCGATGTGCCTCTCATCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGC  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  CCCTCGATGTGCCTCTCATCGGCAAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGC  930

Query  940  GTCTGTGTGCTCAATGTGCACCACCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCT  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  GTCTGTGTGCTCAATGTGCACCACCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCT  1004

Query 1014  GCACAAGCTGCCTACCTTCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCA  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  GCACAAGCTGCCTACCTTCCTCTTCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAGCAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGCCCA  1078

Query 1088  GCAAGTCATGCGTGACCAAGCCCGAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATG  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  GCAAGTCATGCGTGACCAAGCCCGAGGCCACCGCCACCTCCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATG  1152

Query 1162  TACTTTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTT  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153  TACTTTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCTCTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTT  1226

Query 1236  CTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGC  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  CTGGCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGC  1300

Query 1310  ACATGAAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTG  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301  ACATGAAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTG  1374

Query 1384  TTCCTGTGGGTGTTCATGTTTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCA  1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375  TTCCTGTGGGTGTTCATGTTTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCA  1448

Query 1458  TGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC  1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  TGCAGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC  1485