Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00360
• Subject: XM_006495652.3
• Aligned Length: 1023
• Identities: 860
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  28

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            |||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct   29  CTCCCACTGTAACCTTAGTGCAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTCCAGGTCCATGGCGTTATCCAGGCGGCCCAG  102

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CCATCAGTTATCCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  176

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  177  AACTCAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCTGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAAC  250

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  251  GAAGGGAAATCCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGGGTG  324

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  325  CCAAGGATTGAAGAAGAAAAGTCAGAAGAGGAGACTTCAGCCCCTGCCATCACCACTGTAACAGTGCCAACCCC  398

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  CATTTACCAAACTAGCAGTGGGCAGTACATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  472

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  CGGATGGGGTACAGGGCCTGCAGACATTAACCATGACCAATGCAGCTGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  546

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  547  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATTCTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCAGG  620

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  621  CGATGTACAAACATACCAGATCCGCACAGCACCCACGAGCACCATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCGTCCTCCC  694

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  695  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGGAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAGGCA  768

Query  889  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  962
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  769  GCAAGAGAATGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAGAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAACCA  842

Query  963  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  AAACAAAACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  903