Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00360
• Subject: XM_006495653.3
• Aligned Length: 1023
• Identities: 797
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCAGACAACCAGCAGAGTGGAGATGCTGCTGTAACAGAAGCTGAAAATCAACAAAT  74

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCCATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            |||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  149  CTCCCACTGTAACCTTAGTGCAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTCCAGGTCCATGGCGTTATCCAGGCGGCCCAG  222

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCATCAGTTATCCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  AACTCAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCTGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAAC  370

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GAAGGGAAATCCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGGGTG  444

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  445  CCAAGGATTGAAGAAGAAAAGTCAGAAGAGGAGACTTCAGCCCCTGCCATCACCACTGTAACAGTGCCAACCCC  518

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            .||||||||||||||||||||.|||||.|                                             
Sbjct  519  CATTTACCAAACTAGCAGTGGGCAGTACA---------------------------------------------  547

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
                                                                                      
Sbjct  548  --------------------------------------------------------------------------  547

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
                                                                            |||||||.||
Sbjct  548  ----------------------------------------------------------------CTGCCTCAGG  557

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  558  CGATGTACAAACATACCAGATCCGCACAGCACCCACGAGCACCATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCGTCCTCCC  631

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  632  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGGAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAGGCA  705

Query  889  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  962
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  706  GCAAGAGAATGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAGAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAACCA  779

Query  963  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  AAACAAAACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  840