Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00360
• Subject: XM_006495654.3
• Aligned Length: 1023
• Identities: 756
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCCGAGAACCAGCAGAGTGGAGATGCAGCTGTAACAGAAGCTGAAAACCAACAAAT  74
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGAATCTGGAGCAGACAACCAGCAGAGTGGAGATGCTGCTGTAACAGAAGCTGAAAATCAACAAAT  74

Query   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCTATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGTTCAAGCCCAGCCACAGATTGCCACATTAGCCCAGGTATCCATGCCAGCAGCTCATGCAACATCATCTG  148

Query  149  CTCCCACCGTAACTCTAGTACAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTTCAAGTCCATGGAGTCATTCAGGCGGCCCAG  222
            |||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  149  CTCCCACTGTAACCTTAGTGCAGCTGCCCAATGGGCAGACAGTCCAGGTCCATGGCGTTATCCAGGCGGCCCAG  222

Query  223  CCATCAGTTATTCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTTCAGTCTTCCTGTAAGGACTTAAAAAGACTTTTCTCCGG  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  223  CCATCAGTTATCCAGTCTCCACAAGTCCAAACAGTT--------------------------------------  258

Query  297  AACACAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCAGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAGC  370
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  259  ----CAGATTTCAACTATTGCAGAAAGTGAAGATTCACAGGAGTCTGTGGATAGTGTAACTGATTCCCAAAAAC  328

Query  371  GAAGGGAAATTCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGAGTG  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  329  GAAGGGAAATCCTTTCAAGGAGGCCTTCCTACAGGAAAATTTTGAATGACTTATCTTCTGATGCACCAGGGGTG  402

Query  445  CCAAGGATTGAAGAAGAGAAGTCTGAAGAGGAGACTTCAGCACCTGCCATCACCACTGTAACGGTGCCAACTCC  518
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  403  CCAAGGATTGAAGAAGAAAAGTCAGAAGAGGAGACTTCAGCCCCTGCCATCACCACTGTAACAGTGCCAACCCC  476

Query  519  AATTTACCAAACTAGCAGTGGACAGTATATTGCCATTACCCAGGGAGGAGCAATACAGCTGGCTAACAATGGTA  592
            .||||||||||||||||||||.|||||.|                                             
Sbjct  477  CATTTACCAAACTAGCAGTGGGCAGTACA---------------------------------------------  505

Query  593  CCGATGGGGTACAGGGCCTGCAAACATTAACCATGACCAATGCAGCAGCCACTCAGCCGGGTACTACCATTCTA  666
                                                                                      
Sbjct  506  --------------------------------------------------------------------------  505

Query  667  CAGTATGCACAGACCACTGATGGACAGCAGATCTTAGTGCCCAGCAACCAAGTTGTTGTTCAAGCTGCCTCTGG  740
                                                                            |||||||.||
Sbjct  506  ----------------------------------------------------------------CTGCCTCAGG  515

Query  741  AGACGTACAAACATACCAGATTCGCACAGCACCCACTAGCACTATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCATCCTCCC  814
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  516  CGATGTACAAACATACCAGATCCGCACAGCACCCACGAGCACCATTGCCCCTGGAGTTGTTATGGCGTCCTCCC  589

Query  815  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGAAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAAGCA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  590  CAGCACTTCCTACACAGCCTGCTGAAGAAGCAGCACGGAAGAGAGAGGTCCGTCTAATGAAGAACAGGGAGGCA  663

Query  889  GCTCGAGAGTGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAAAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAATCA  962
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  664  GCAAGAGAATGTCGTAGAAAGAAGAAAGAATATGTGAAATGTTTAGAGAACAGAGTGGCAGTGCTTGAAAACCA  737

Query  963  AAACAAGACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  1023
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  AAACAAAACATTGATTGAGGAGCTAAAAGCACTTAAGGACCTTTACTGCCACAAATCAGAT  798