Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00412
- Subject:
- NM_001256497.3
- Aligned Length:
- 1617
- Identities:
- 1341
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA 74
|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTCATCCCAAACTTGGCCGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGATACTCCTCTATCTATA 74
Query 75 TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG 148
|||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 TGGAACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATG 148
Query 149 TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCT-CTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAAC 221
.||||||||..|||.|||| || .||||..|||||||..||.||.||||||||||||.|||||.|.|||||.|.
Sbjct 149 CTTTGTCCTTCCGTAAGGG-CTATTGGACGTTTGACATGGAATGTTATAAAAAGTATAGAAAAGTCTGGGGTAT 221
Query 222 GTATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTT 295
.|||||..||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TTATGACTGTCAACAGCCTATGCTGGCTATCACAGATCCCGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTT 295
Query 296 ATTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGAT 369
||||||||||||||||.||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct 296 ATTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTCGGGCCAGTGGGATTTATGAAAAATGCCATCTCTATAGCTGAGGAT 369
Query 370 GAAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCAT 443
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 370 GAAGAATGGAAGAGAATACGATCATTGCTGTCTCCAACATTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTAT 443
Query 444 CATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGA 517
|||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 444 CATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGA 517
Query 518 AAGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAAC 591
||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 518 AACACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAGCATCGACTCTCTCAAC 591
Query 592 AATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTC 665
|||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.||||..|...|||||||||||..|||||||
Sbjct 592 AATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTAATCCATTAGATCCATTCGTTCTCTC 665
Query 666 AATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCC---AAAAGATACCA 736
|||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||| |||||.| |
Sbjct 666 AATAAAAGTCTTTCCATTCCTTACCCCAATTCTTGAAGCATTAAATATCACTGTGTTTCCAAGAAAAGTT---A 736
Query 737 TAAATTTTTTAAGTAAATCTGT-AAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGA 809
|||.||||.|||..|||||||| |||||| ||.||..||.||||||||||.||.|.|||||||||||||.|.||
Sbjct 737 TAAGTTTTCTAACAAAATCTGTAAAACAG-ATAAAAGAAGGTCGCCTCAAAGAGACACAAAAGCACCGAGTGGA 809
Query 810 TTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC 883
||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 TTTCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGACTCTGAGACCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGC 883
Query 884 TCGCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATAT 957
||...|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|||||
Sbjct 884 TCATGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATATAT 957
Query 958 GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACC 1031
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 958 GAACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAAGTGCAGAAGGAAATTGATACAGTTTTACCCAATAAGGCACC 1031
Query 1032 ACCTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAG 1105
|||.|||||||||.|.|||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 ACCCACCTATGATACTGTGCTACAGTTGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAG 1105
Query 1106 TTGCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATG 1179
|||||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||....||
Sbjct 1106 TTGCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAAATCAATGGGATGTTTATTCCCAAAGGGGTGGTG 1179
Query 1180 GTGGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAG 1253
|||.|||||||||..||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1180 GTGATGATTCCAAGCTATGTTCTTCATCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAG 1253
Query 1254 GTTCAGT---AAGAAGAAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCA 1324
||||||| |||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1254 GTTCAGTAAAAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCA 1327
Query 1325 TTGGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCT 1398
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 TTGGCATGAGGTTTGCTCTCGTGAACATGAAACTTGCTCTAGTCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCT 1401
Query 1399 TGTAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGACACGC----AAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTC 1468
|||||||||||||||||||||.||||||| |||| .|||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1402 TGTAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATT----ACGCTTTGGAGGACTTCTTCTAACAGAAAAACCCATTGTTC 1471
Query 1469 TAAAGGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA------------------------------------ 1506
||||||..||.|||||.||||..|||.| ||.|||.
Sbjct 1472 TAAAGGCTGAGTCAAGGGATGAGACCTT---TGTAGATATGGAGCCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTG 1542
Query 1507 --------------------------------------------------------------- 1506
Sbjct 1543 GCATTCCAGGGCCCACACCTCTGCTTTTTTTGGGAACTACTTTGTCCTACCATCAGATCCCGC 1605