Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00431
• Subject: XM_011542645.1
• Aligned Length: 1449
• Identities: 1302
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCACGGCCAGAACAGAGAACCCTGTTATAATGGGTCTGTCCAGTCAAAATGGTCAGCTGAGAGGCCCTGT  74

Query   75  GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAACCCACTGGTGGCCCTGGAGGAGGGGGCACACAGACACAGCAACAGATGAACCAGCTGAAAAACACCAACA  148

Query  149  CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGTATGACCACCACTATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAG  222

Query  223  ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATCAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGA  296

Query  297  AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATTACTGTTTGAAACGGGAGTTACTGATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAGCCATCTCCTATTCAGG  370

Query  371  AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAGAGCGGT  444

Query  445  GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACAAGCAATGGTGATTGTTCCCAC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  445  GCCTACCTCATTCCCTTACTTGAACGGCTAGACCTGAAGAAGGACAATATACA---------------------  497

Query  519  TAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGG  592
                                                                                      
Sbjct  498  --------------------------------------------------------------------------  497

Query  593  CAACCACAGGAGGAACCAATTTACGAGATGACATAATGAGGCTTGATGATACAGTGCACGTGGTGATTGCTACC  666
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  ----------------------------------------------------AGTGCACGTGGTGATTGCTACC  519

Query  667  CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  CCTGGGAGAATCCTGGATCTTATTAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGA  593

Query  741  GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GGCAGATAAGTTGCTGTCACAGGATTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACGCTACCTAAAAACAGGC  667

Query  815  AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCATGAATTCCCATTTGCAGAAACCCTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  AGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAGAAGTTCATGAATTCCCATTTGCAGAAACCCTAT  741

Query  889  GAGATTAACCTGATGGAGGAACTAACTCTGAAGGGAGTAACCCAGTACTACGCATATGTAACTGAGCGCCAAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  GAGATTAACCTGATGGAGGAACTAACTCTGAAGGGAGTAACCCAGTACTACGCATATGTAACTGAGCGCCAAAA  815

Query  963  AGTACACTGCCTCAACACACTTTTCTCCAGGCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  AGTACACTGCCTCAACACACTTTTCTCCAGGCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGTAACTCCTCTCAGC  889

Query 1037  GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  GAGTTGAATTGCTAGCCAAGAAGATTTCTCAACTGGGTTATTCTTGCTTCTATATTCATGCTAAAATGAGGCAG  963

Query 1111  GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  GAACATCGAAATCGTGTATTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTAC  1037

Query 1185  CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038  CCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGATTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTCC  1111

Query 1259  ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112  ATCGTATTGGAAGATCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTC  1185

Query 1333  AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186  AACCTGAAAAGTATTGAGGAGCAGCTGGGAACAGAAATTAAACCTATTCCGAGCAACATTGATAAGAGCCTGTA  1259

Query 1407  TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT  1449
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260  TGTGGCAGAATACCACAGCGAGCCTGTAGAAGATGAGAAACCT  1302