Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00446
- Subject:
- NM_001142463.3
- Aligned Length:
- 1542
- Identities:
- 1526
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGCGGATGCGGAAGTAATTATTTTGCCAAAGAAACATAAGAAGAAAAAGGAGCGGAAGTCATTGCCAGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGATGCGGAAGTAATTATTTTGCCAAAGAAACATAAGAAGAAAAAGGAGCGGAAGTCATTGCCAGAAGA 74
Query 75 AGATGTAGCCGAAATACAACACGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCTGAATCCAAAGTTGCTAAGTTGGACACGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATGTAGCCGAAATACAACACGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCTGAATCCAAAGTTGCTAAGTTGGACACGT 148
Query 149 CTCAGTGGCCCCTTTTGCTAAAGAATTTTGATAAGCTGAATGTAAGGACAACACACTATACACCTCTTGCATGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCAGTGGCCCCTTTTGCTAAAGAATTTTGATAAGCTGAATGTAAGGACAACACACTATACACCTCTTGCATGT 222
Query 223 GGTTCAAATCCTCTGAAGAGAGAGATTGGGGACTATATCAGGACAGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTCTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTTCAAATCCTCTGAAGAGAGAGATTGGGGACTATATCAGGACAGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTCTAA 296
Query 297 CCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATTCGACGGATACTTCGGGTGGAGAAGACAGGGCACAGTGGTACTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATTCGACGGATACTTCGGGTGGAGAAGACAGGGCACAGTGGTACGC 370
Query 371 TGGATCCCAAGGTGACTGGTTGTTTAATCGTGTGCATAGAACGAGCCACTCGCTTGGTGAAGTCACAACAGAGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGATCCCAAGGTGACTGGTTGTTTAATCGTGTGCATAGAACGAGCCACTCGCTTGGTGAAGTCACAACAGAGT 444
Query 445 GCAGGCAAAGAGTATGTGGGGATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGGACCCAGCTTTCTAGGGCCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGGCAAAGAGTATGTGGGGATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGGACCCAGCTTTCTAGGGCCCT 518
Query 519 AGAAACTCTGACAGGTGCCTTATTCCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTCCGAGTGAGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAAACTCTGACAGGTGCCTTATTCCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTCCGAGTGAGGA 592
Query 593 CCATCTACGAGAGCAAAATGATTGAATACGATCCTGAAAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTGAGTTGTGAGGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCATCTACGAGAGCAAAATGATTGAATACGATCCTGAAAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTGAGTTGTGAGGCT 666
Query 667 GGCACCTACATTCGGACATTATGTGTGCACCTTGGTTTGTTATTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAGCTTCG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCACCTACATTCGGACATTATGTGTGCACCTTGGTTTGTTATTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAGCTTCG 740
Query 741 GAGGGTTCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTGCTTGATGCTCAGTGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGGGTTCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTGCTTGATGCTCAGTGGC 814
Query 815 TGTATGATAACCACAAGGATGAGAGTTACCTGCGGCGAGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCTCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTATGATAACCACAAGGATGAGAGTTACCTGCGGCGAGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCTCAT 888
Query 889 AAACGGCTGGTTATGAAAGACAGTGCAGTAAATGCCATCTGCTATGGGGCCAAGATTATGCTTCCAGGTGTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAACGGCTGGTTATGAAAGACAGTGCAGTAAATGCCATCTGCTATGGGGCCAAGATTATGCTTCCAGGTGTTCT 962
Query 963 TCGATATGAGGACGGCATTGAGGTCAATCAGGAGATTGTGGTTATCACCACCAAAGGAGAAGCAATCTGCATGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGATATGAGGACGGCATTGAGGTCAATCAGGAGATTGTGGTTATCACCACCAAAGGAGAAGCAATCTGCATGG 1036
Query 1037 CTATTGCATTAATGACCACAGCGGTCATCTCTACCTGCGACCATGGTATAGTAGCCAAGATCAAGAGAGTGATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTATTGCATTAATGACCACAGCGGTCATCTCTACCTGCGACCATGGTATAGTAGCCAAGATCAAGAGAGTGATC 1110
Query 1111 ATGGAGAGAGACACTTACCCTCGGAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGCTGATGATCAAGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGGAGAGAGACACTTACCCTCGGAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGCTGATGATCAAGCA 1184
Query 1185 GGGCCTTCTGGACAAGCATGGGAAGCCCACAGACAGCACACCTGCCACCTGGAAGCAGGAGTATGTTGACTACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGCCTTCTGGACAAGCATGGGAAGCCCACAGACAGCACACCTGCCACCTGGAAGCAGGA-------------- 1244
Query 1259 GTGAGTCTGCCAAAAAAGAGGTGGTTGCTGAAGTGGTAAAAGCCCCGCAGGTAGTTGCCGAAGCAGCAAAAACT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 -TGAGTCTGCCAAAAAAGAGGTGGTTGCTGAAGTGGTAAAAGCCCCGCAGGTAGTTGCCGAAGCAGCAAAAACT 1317
Query 1333 GCGAAGCGGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGAAAGTGACGAGACTCCTCCAGCAGCTCCTCAGTTGATCAAGAAGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GCGAAGCGGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGAAAGTGACGAGACTCCTCCAGCAGCTCCTCAGTTGATCAAGAAGGA 1391
Query 1407 AAAGAAGAAGAGTAAGAAGGACAAGAAGGCCAAAGCTGGTCTGGAGAGCGGGGCCGAGCCTGGAGATGGGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 AAAGAAGAAGAGTAAGAAGGACAAGAAGGCCAAAGCTGGTCTGGAGAGCGGGGCCGAGCCTGGAGATGGGGACA 1465
Query 1481 GTGATACCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAAAGAGGTAGAATTGGTTTCTGAG 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 GTGATACCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAAAGAGGTAGAATTGGTTTCTGAG 1527