Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00464
• Subject: NM_001198941.2
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1106
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74

Query   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148

Query  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222

Query  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296

Query  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370

Query  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444

Query  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518

Query  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592

Query  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666

Query  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740

Query  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814

Query  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888

Query  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962

Query  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACCC  1036

Query 1037  TGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGC------------TCGGACGGTGCT  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||..||.| |||
Sbjct 1037  TGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCATGCTTGAGAGTTCAAACCG-GCT  1109

Query 1099  T-------------------TT----GGTGGATGCGTC------------------------------------  1113
            |                   ||    |||  |||||.|                                    
Sbjct 1110  TGATGAAGAACACAGGCTAATTGCCAGGT--ATGCGGCAAGGCTGGCAGCAGAGTCCTCTTCGTCTCAGCCACC  1181

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1182  TCAGCAGAGAAGTGCTCCTGACATCTCTTTCACCATCGATGCGAATAAGCAGCAAAGGCAGCTGATTGCTGAGC  1255

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1256  TAGAAAACAAGAACAGAGAAATCTTACAGGAGATCCAGAGACTTCGGCTAGAGCATGAACAAGCTTCTCAGCCC  1329

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1330  ACGCCAGAGAAGGCACAGCAAAACCCCACCCTGCTGGCAGAACTCCGGCTCCTCAGACAGCGCAAAGATGAGCT  1403

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1404  GGAACAGAGAATGTCTGCTCTCCAGGAGAGCCGGAGAGAGCTAATGGTCCAGTTGGAGGGTCTCATGAAGCTAC  1477

Query 1114  -----------------------------------------------------  1113
                                                                 
Sbjct 1478  TAAAGGAAGAAGAACTGAAGCAGGGAGTAAGTTATGTCCCCTACTGCAGGTCT  1530