Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00464
- Subject:
- NM_032978.7
- Aligned Length:
- 1702
- Identities:
- 1107
- Gaps:
- 590
Alignment
Query 1 ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA 74
Query 75 AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT 148
Query 149 TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT 222
Query 223 GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC 296
Query 297 TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC 370
Query 371 ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA 444
Query 445 AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA 518
Query 519 AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT 592
Query 593 TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG 666
Query 667 GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA 740
Query 741 CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT 814
Query 815 GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT 888
Query 889 AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC 962
Query 963 AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACCC 1036
Query 1037 TGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCTC---------GGACGGTG----- 1096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|||
Sbjct 1037 TGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCTCTCCTCCCAAGGACAGTGAAGTA 1110
Query 1097 ------------CTTTTGG---TGGATGCGTC------------------------------------------ 1113
||..||| .||.||| ||
Sbjct 1111 GAGCAGAACAAACTGCTGGCTAGGGCTGC-TCCAGCTTTTCTGAAGGGCAAAGGGATACAGTACAGCCTGAATG 1183
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1184 TGGCAGACAGGCTAGCTGATGAACATGTTCTCATCGGGTTGTATGTCAACATGCTCCGGAACAACCCCTCATGC 1257
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1258 ATGCTTGAGAGTTCAAACCGGCTTGATGAAGAACACAGGCTAATTGCCAGGTATGCGGCAAGGCTGGCAGCAGA 1331
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1332 GTCCTCTTCGTCTCAGCCACCTCAGCAGAGAAGTGCTCCTGACATCTCTTTCACCATCGATGCGAATAAGCAGC 1405
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1406 AAAGGCAGCTGATTGCTGAGCTAGAAAACAAGAACAGAGAAATCTTACAGGAGATCCAGAGACTTCGGCTAGAG 1479
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1480 CATGAACAAGCTTCTCAGCCCACGCCAGAGAAGGCACAGCAAAACCCCACCCTGCTGGCAGAACTCCGGCTCCT 1553
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1554 CAGACAGCGCAAAGATGAGCTGGAACAGAGAATGTCTGCTCTCCAGGAGAGCCGGAGAGAGCTAATGGTCCAGT 1627
Query 1114 -------------------------------------------------------------------------- 1113
Sbjct 1628 TGGAGGGTCTCATGAAGCTACTAAAGGAAGAAGAACTGAAGCAGGGAGTAAGTTATGTCCCCTACTGCAGGTCT 1701