Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00464
• Subject: NM_032979.5
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1106
• Gaps: 432

Alignment

Query    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74

Query   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148

Query  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222

Query  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296

Query  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370

Query  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444

Query  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518

Query  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592

Query  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666

Query  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740

Query  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814

Query  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888

Query  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962

Query  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGT---------GCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGA  1027
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTTGATACTTGGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGA  1036

Query 1028  ACGACACCCTGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGC------------TCG  1089
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||.
Sbjct 1037  ACGACACCCTGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCATGCTTGAGAGTTCA  1110

Query 1090  GACGGTGCTT-------------------TT----GGTGGATGCGTC---------------------------  1113
            .||.| ||||                   ||    |||  |||||.|                           
Sbjct 1111  AACCG-GCTTGATGAAGAACACAGGCTAATTGCCAGGT--ATGCGGCAAGGCTGGCAGCAGAGTCCTCTTCGTC  1181

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1182  TCAGCCACCTCAGCAGAGAAGTGCTCCTGACATCTCTTTCACCATCGATGCGAATAAGCAGCAAAGGCAGCTGA  1255

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1256  TTGCTGAGCTAGAAAACAAGAACAGAGAAATCTTACAGGAGATCCAGAGACTTCGGCTAGAGCATGAACAAGCT  1329

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1330  TCTCAGCCCACGCCAGAGAAGGCACAGCAAAACCCCACCCTGCTGGCAGAACTCCGGCTCCTCAGACAGCGCAA  1403

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1404  AGATGAGCTGGAACAGAGAATGTCTGCTCTCCAGGAGAGCCGGAGAGAGCTAATGGTCCAGTTGGAGGGTCTCA  1477

Query 1114  --------------------------------------------------------------  1113
                                                                          
Sbjct 1478  TGAAGCTACTAAAGGAAGAAGAACTGAAGCAGGGAGTAAGTTATGTCCCCTACTGCAGGTCT  1539