Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00464
• Subject: XM_030250321.1
• Aligned Length: 1547
• Identities: 1025
• Gaps: 442

Alignment

Query    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATTGAAGATAGTGGAAAAAGAGGAAACACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74

Query   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTGAGATTTGTGCAGAAGAAATGCAATT  148

Query  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||..
Sbjct  149  TGCACCTGGTGGACATTTGGAACGTCATTGAAGCATTGCGCGAAAACGCTTTGAATAACCTGGACCCAAACATA  222

Query  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296
            ||||||||||||.|||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  223  GAACTCAACGTGGCCCGCCTGGAGGCGGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAGAGGATGCCAACCAC  296

Query  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  TCACCAAATCCACGTGGAGCAGTCCATCAGTCTCCTGCTGAACTTCCTGCTCGCAGCCTTTGACCCGGAAGGCC  370

Query  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  ATGGAAAAATCTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTGGCTACATTGTGTGGAGGAAAGATCATGGACAAGTTA  444

Query  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATATATTTTCTCAATGATCTCTGACTCCAGTGGAGTGATGGTATATGGAAGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518

Query  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTCTCAAACTACCCACAGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592

Query  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  593  TCTCCCAACAGAAAAAGGTCACCTTAAATGGCTTCTTGGACACGCTCATGTCAGACCCTCCTCCACAGTGCCTG  666

Query  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740
            ||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GTATGGCTGCCTCTTCTGCACCGACTGGCAAATGTAGAAAATGTCTTCCATCCAGTTGAGTGTTCCTACTGTCA  740

Query  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGAGAGCATGATGGGATTTCGATACCGATGTCAACAGTGTCACAACTACCAGCTTTGCCAGGACTGCTTCT  814

Query  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888
            |||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GGAGGGGCCATGCAGGAGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAGGAGTATACGTCGTGGAAATCACCTGCT  888

Query  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGCTAACGAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCAAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962

Query  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGT---------GCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGA  1027
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||         ||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACCAGCCTGAAAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTTGATACTTGGCCTCCGAGACCTGTAACCAGCATGA  1036

Query 1028  ACGACACCCTGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCTCGGACGGTGCTT--  1099
            |||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||       ..|||||  
Sbjct 1037  ACGACACACTCTTTTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTCATCACCAGGAG-------TATGCTTGA  1103

Query 1100  --------------TTGGTG-------------GATGCGTC---------------------------------  1113
                          |||.||             ||| ||.|                                 
Sbjct 1104  GAGTTCAAACCGGCTTGATGAAGAACACAGGCTGAT-CGCCAGGTACGCCGCACGACTGGCAGCAGAATCCTCC  1176

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1177  TCATCACAGCCCACACAGCAGAGGAGTGCCCCTGACATCTCCTTCACCATCGATGCAAATAAACAGCAAAGGCA  1250

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1251  GCTGATTGCAGAGCTAGAGAACAAGAACAGAGAAATCTTACAAGAGATTCAGAGACTTCGGGTAGAACATGAGC  1324

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1325  AAGCTTCCCAGCCCACGCCAGAGAAAGCTCAGCAGAACCCAACCTTGCTGGCAGAACTCCGGCTCCTCAGACAG  1398

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1399  CGAAAGGATGAGCTAGAACAGAGAATGTCTGCTCTCCAGGAGAGCCGGAGAGAGCTGATGGTCCAGTTGGAAGG  1472

Query 1114  -------------------------------------------------------------------  1113
                                                                               
Sbjct 1473  TCTCATGAAGCTCCTGAAGGAAGAAGAACTGAAGCAGGGAGTAAGTTATGTCCCCTACTGCAGGTCT  1539