Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00464
• Subject: XM_030250322.1
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1025
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  ATGATTGAAGATAGTGGGAAAAGAGGAAATACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATTGAAGATAGTGGAAAAAGAGGAAACACCATGGCAGAAAGAAGACAGCTGTTTGCAGAGATGAGGGCTCA  74

Query   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTTAGGTTTGTTCAGAAGAAATGCAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATCTGGATCGCATCCGACTCTCCACCTACAGAACAGCATGCAAGCTGAGATTTGTGCAGAAGAAATGCAATT  148

Query  149  TGCACCTGGTGGACATATGGAATGTCATAGAAGCATTGCGGGAAAATGCTCTGAACAACCTGGACCCAAACACT  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||||..
Sbjct  149  TGCACCTGGTGGACATTTGGAACGTCATTGAAGCATTGCGCGAAAACGCTTTGAATAACCTGGACCCAAACATA  222

Query  223  GAACTCAACGTGTCCCGCTTAGAGGCTGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAACGGATGCCAACCAC  296
            ||||||||||||.|||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  223  GAACTCAACGTGGCCCGCCTGGAGGCGGTGCTCTCCACTATTTTTTACCAGCTCAACAAGAGGATGCCAACCAC  296

Query  297  TCACCAAATCCATGTGGAGCAGTCCATCAGCCTCCTCCTTAACTTCCTGCTTGCAGCGTTTGATCCGGAAGGCC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  TCACCAAATCCACGTGGAGCAGTCCATCAGTCTCCTGCTGAACTTCCTGCTCGCAGCCTTTGACCCGGAAGGCC  370

Query  371  ATGGTAAAATTTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTAGCCACATTGTGTGGAGGGAAGATCATGGACAAATTA  444
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  ATGGAAAAATCTCAGTATTTGCTGTCAAAATGGCTTTGGCTACATTGTGTGGAGGAAAGATCATGGACAAGTTA  444

Query  445  AGATATATTTTCTCAATGATTTCTGACTCCAGTGGGGTGATGGTTTATGGACGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATATATTTTCTCAATGATCTCTGACTCCAGTGGAGTGATGGTATATGGAAGATATGACCAATTCCTTCGGGA  518

Query  519  AGTTCTCAAACTACCCACGGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTCTCAAACTACCCACAGCAGTTTTTGAAGGTCCTTCATTTGGTTACACAGAACAGTCAGCCAGATCCTGTT  592

Query  593  TCTCCCAACAGAAAAAAGTCACGTTAAATGGTTTCTTGGACACGCTTATGTCAGATCCTCCCCCGCAGTGTCTG  666
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  593  TCTCCCAACAGAAAAAGGTCACCTTAAATGGCTTCTTGGACACGCTCATGTCAGACCCTCCTCCACAGTGCCTG  666

Query  667  GTCTGGTTGCCTCTTCTGCATCGACTAGCAAATGTGGAAAATGTCTTCCATCCGGTTGAGTGTTCCTACTGCCA  740
            ||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GTATGGCTGCCTCTTCTGCACCGACTGGCAAATGTAGAAAATGTCTTCCATCCAGTTGAGTGTTCCTACTGTCA  740

Query  741  CAGTGAGAGTATGATGGGATTTCGCTACCGATGCCAACAGTGTCACAATTACCAGCTCTGTCAGGACTGCTTCT  814
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGAGAGCATGATGGGATTTCGATACCGATGTCAACAGTGTCACAACTACCAGCTTTGCCAGGACTGCTTCT  814

Query  815  GGAGGGGACATGCCGGTGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAAGAGTACACGTCATGGAAATCACCTGCT  888
            |||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GGAGGGGCCATGCAGGAGGTTCTCATAGCAACCAGCACCAAATGAAGGAGTATACGTCGTGGAAATCACCTGCT  888

Query  889  AAGAAGCTGACTAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCCAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGCTAACGAATGCATTAAGCAAGTCCCTGAGCTGTGCTTCAAGCCGTGAACCTTTGCACCCCATGTTCCC  962

Query  963  AGATCAGCCTGAGAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCCAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACCC  1036
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGACCAGCCTGAAAAGCCACTCAACTTGGCTCACATCGTGCCTCCGAGACCTGTAACCAGCATGAACGACACAC  1036

Query 1037  TGTTCTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTTATTACCAGGAGCTCGGACGGTGCTT-----------  1099
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||       ..|||||           
Sbjct 1037  TCTTTTCCCACTCTGTTCCCTCCTCAGGAAGTCCTTTCATCACCAGGAG-------TATGCTTGAGAGTTCAAA  1103

Query 1100  -----TTGGTG-------------GATGCGTC------------------------------------------  1113
                 |||.||             ||| ||.|                                          
Sbjct 1104  CCGGCTTGATGAAGAACACAGGCTGAT-CGCCAGGTACGCCGCACGACTGGCAGCAGAATCCTCCTCATCACAG  1176

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1177  CCCACACAGCAGAGGAGTGCCCCTGACATCTCCTTCACCATCGATGCAAATAAACAGCAAAGGCAGCTGATTGC  1250

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1251  AGAGCTAGAGAACAAGAACAGAGAAATCTTACAAGAGATTCAGAGACTTCGGGTAGAACATGAGCAAGCTTCCC  1324

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1325  AGCCCACGCCAGAGAAAGCTCAGCAGAACCCAACCTTGCTGGCAGAACTCCGGCTCCTCAGACAGCGAAAGGAT  1398

Query 1114  --------------------------------------------------------------------------  1113
                                                                                      
Sbjct 1399  GAGCTAGAACAGAGAATGTCTGCTCTCCAGGAGAGCCGGAGAGAGCTGATGGTCCAGTTGGAAGGTCTCATGAA  1472

Query 1114  ----------------------------------------------------------  1113
                                                                      
Sbjct 1473  GCTCCTGAAGGAAGAAGAACTGAAGCAGGGAGTAAGTTATGTCCCCTACTGCAGGTCT  1530