Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00507
• Subject: NM_001323385.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1149
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  74

Query   75  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  148

Query  149  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  222

Query  223  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  296

Query  297  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  370

Query  371  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  444

Query  445  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  518

Query  519  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  592

Query  593  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  666

Query  667  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  740

Query  741  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  814

Query  815  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  888

Query  889  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  889  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGC-------  955

Query  963  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGACCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  1036
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  956  -----------------------------------------------------------AGATCTATCCCTATG  970

Query 1037  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  971  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1044

Query 1111  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1118

Query 1185  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1215
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1149