Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00507
• Subject: NM_001323387.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1074
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ATGGAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  74
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct    1  ATGGAACGGCTGCAGAA---------------------------------------------------------  17

Query   75  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  148
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  ------------------GGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  73

Query  149  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  147

Query  223  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  221

Query  297  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  295

Query  371  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  369

Query  445  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  443

Query  519  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  517

Query  593  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  591

Query  667  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  665

Query  741  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  739

Query  815  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  813

Query  889  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  814  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGC-------  880

Query  963  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGACCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  1036
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  881  -----------------------------------------------------------AGATCTATCCCTATG  895

Query 1037  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  969

Query 1111  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1043

Query 1185  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1215
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1074