Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00507
• Subject: XM_006518541.2
• Aligned Length: 1215
• Identities: 1025
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGGAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  74
            ||||||||.||||||||                                                         
Sbjct    1  ATGGAACGTCTGCAGAA---------------------------------------------------------  17

Query   75  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  148
                              |||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   18  ------------------GGCCAAGATGGACAACCAGGTGTTGGGCTACAAGGATCTGGCTGCCATCCCCAAGG  73

Query  149  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  222
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct   74  ACAAGGCCATCCTGGACATTGAGCGACCTGACCTCATGATCTATGAGCCCCACTTTACCTATTCCCTCCTGGAA  147

Query  223  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  296
            ||.||.||||||||..|.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  148  CATGTAGAGCTGCCCAGAAGCCGGGAGTGCTCACTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCGTCTCCAGAGGT  221

Query  297  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  370
            |||||||||.||||||.|.|.||||||||||||||||||.||..||||.||.|||||.||.||||||.||||||
Sbjct  222  GTGGGCGGAGAGCCGGACTCTTGGAATCATCTCTCAGGCTTCAACCCCAAGGACCACAGGGACCCCCAGGACCA  295

Query  371  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  296  GCCTGCCCCACTTCCACCACCCTGAGACTACCCGCCCGGATTCCAACATCTACAAGAAGCCACCCATCTACAAA  369

Query  445  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  518
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  370  CAGAGAGAATCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGAGCAAGCACCTCATCGAGGACCTCATCATCGAATCCTCCAAGTT  443

Query  519  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  592
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  444  TCCTGCAGCGCAGCCCCCTGACCCCAACCAGCCAGCCAAGATAGAGACTGACTACTGGCCATGTCCCCCGTCGC  517

Query  593  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  666
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  518  TGGCCGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAACGGAAGGCATCTCGAAAGGGGGCAGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAA  591

Query  667  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  740
            ||.||.|||||||.|||||||||.|||||..|||||||.||.||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GACGATGACTCTGAAGAGGAGATTAAGGCCATCAGGGAACGGCAGAAAGAGGAGCTCAGTAAGGTTACTTCCAA  665

Query  741  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  666  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCCATCCGGAGGAAAACACGCTCTCTGCCTG  739

Query  815  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||...||||||.||||||||.||.||.||.||..||||||||||||||
Sbjct  740  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCATTCGGGAACATCTAAATCCTCTTCGCTTCCTTCCTATGGCAGGACC  813

Query  889  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAATTCAGCCCATCGGGAAGTGAGGCTGGGAGCCCAGGCCTGCAGAACGG  887

Query  963  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGACCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGAGGGCCAGAGGGGGAGGATGGATCGGGGGAACTCCCTGCCCTGTGTGCTGGAGCAGAAGATCTATCCCTATG  961

Query 1037  AAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTGAGAGGCAT  1110
            |.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||||||
Sbjct  962  AGATGCTGGTGGTGACCAATAAGGGGAGAACTAAGCTGCCTCCGGGTGTGGACCGCATGAGGCTTGAGAGGCAT  1035

Query 1111  CTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTGTGGAAGCG  1184
            .||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  TTGTCAGCAGAGGACTTCTCTAGGGTCTTCGCCATGTCTCCCGAGGAGTTTGGCAAGCTGGCCCTGTGGAAGCG  1109

Query 1185  GAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1215
            |||.||.||.||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1110  GAACGAACTTAAGAAGAAAGCTTCCCTCTTC  1140