Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: NM_001163150.1
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1283
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                              ||.|           ||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT  13

Query  149  TAAGT-CAA---------TTACAGGAAACATGGCTTG---------CAGA-----AGCTCAGGTACCTGACAAT  198
            ||||| |||         ||.||         .||||         ||||     |||||||||||||||||||
Sbjct   14  TAAGTGCAAGTGTCTTCTTTCCA---------CCTTGTTCACAACACAGAACGTTAGCTCAGGTACCTGACAAT  78

Query  199  GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA  152

Query  273  ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA  226

Query  347  AGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCA  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  AGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCA  300

Query  421  TCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTT  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  TCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTT  374

Query  495  CCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGC  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGC  448

Query  569  TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG  522

Query  643  ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA  596

Query  717  CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG  670

Query  791  CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA  744

Query  865  ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA  818

Query  939  TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT  892

Query 1013  GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA  966

Query 1087  TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA  1040

Query 1161  TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT  1114

Query 1235  ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA  1188

Query 1309  GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC  1262

Query 1383  GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1311