Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: NM_001163151.1
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1242
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                              ||.|           ||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT  13

Query  149  TAAGT-CAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTA  221
            ||||| |||           .||.|||                ||..|         ||..||||.|   || |
Sbjct   14  TAAGTGCAA-----------GTGTCTT----------------CTTTC---------CACCTTGTTC---AC-A  47

Query  222  TCAGGCTGAAAGTT--TGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGA  293
            .||  |.|||.|||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  ACA--CAGAACGTTAGTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGA  119

Query  294  AATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  AATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTG  193

Query  368  CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  CCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCA  267

Query  442  CTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATC  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  CTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATC  341

Query  516  GCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  GCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCT  415

Query  590  TTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  TTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCC  489

Query  664  TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  TTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGC  563

Query  738  CAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  CAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTA  637

Query  812  GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAA  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  GCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAA  711

Query  886  AAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  AAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCC  785

Query  960  AGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  AGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTC  859

Query 1034  TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAA  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  TGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAA  933

Query 1108  GAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  GAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCG  1007

Query 1182  CTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  CTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAG  1081

Query 1256  AAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAAC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  AAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAAC  1155

Query 1330  GAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  GAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCC  1229

Query 1404  CCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230  CCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1257