Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00520
- Subject:
- NM_001163152.1
- Aligned Length:
- 1455
- Identities:
- 1094
- Gaps:
- 357
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
||.| ||||||||.
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGC-----------TTCAAGATT 13
Query 149 TAAGT-CAA---------TTACAGGAAACATGGCTTG---------CAGA-----AGCTCAGGTACCTGACAAT 198
||||| ||| ||.|| .|||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 14 TAAGTGCAAGTGTCTTCTTTCCA---------CCTTGTTCACAACACAGAACGTTAGCTCAGGTACCTGACAAT 78
Query 199 GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 GATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGA 152
Query 273 ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 ACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAA 226
Query 347 AGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCA 420
||||||||||||||||
Sbjct 227 AGTGCCTGTACAATGT---------------------------------------------------------- 242
Query 421 TCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTT 494
Sbjct 243 -------------------------------------------------------------------------- 242
Query 495 CCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGC 568
|||||||||||||||||
Sbjct 243 ---------------------------------------------------------CAGATTTCGCCGCCAGC 259
Query 569 TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 TTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAG 333
Query 643 ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAA 407
Query 717 CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 CACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTG 481
Query 791 CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 CATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGA 555
Query 865 ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 ACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGA 629
Query 939 TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630 TGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCT 703
Query 1013 GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704 GGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAA 777
Query 1087 TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGA 851
Query 1161 TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 TAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCT 925
Query 1235 ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 ACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACA 999
Query 1309 GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 GACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCC 1073
Query 1383 GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 GGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1122