Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00520
- Subject:
- NM_001347379.1
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1288
- Gaps:
- 54
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACGTGGTCACCAACAGTCAGCGTGGGAGAAACTGTACCGAGAA 74
Query 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC 148
Query 149 TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTAT 222
|.|||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 149 TGAGTCAGTTACAAGAAACATGGCTTGCTGAAG----------------------------------------- 181
Query 223 CAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAAT 296
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 182 -------------TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACT 242
Query 297 CAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCT 370
|.|.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 CGGGTCTGCTTGCAGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCT 316
Query 371 ATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 317 ATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTA 390
Query 445 CATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCA 518
||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 391 CACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCA 464
Query 519 GTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTC 592
||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 465 GTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTC 538
Query 593 CTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC 666
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC 612
Query 667 CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 613 CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAG 686
Query 741 CCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT 814
|||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 CCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT 760
Query 815 GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 761 GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAG 834
Query 889 GGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGG 962
||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 835 GGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGG 908
Query 963 AATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG 1036
||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 AATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG 982
Query 1037 ATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAG 1110
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 983 ATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAG 1056
Query 1111 GTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTA 1184
||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1057 GTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTA 1130
Query 1185 TTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAG 1258
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1131 TTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAG 1204
Query 1259 CCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAG 1332
||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1205 CCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAA 1278
Query 1333 GAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCA 1406
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1279 GAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCA 1352
Query 1407 CCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
|||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1353 CCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC 1377