Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: XM_006514964.3
• Aligned Length: 1492
• Identities: 1321
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGATGGATTTTATGA  17
                                                                     .|||.|||.|||     
Sbjct    1  ATGTCCACGATGAGTGCAAGAGGAGACGGAGGGCAGCAACAGCTGCACTCAAAGTTTGTGGCTGGGTTT-----  69

Query   18  CCAGCAAGTGCCTTACATGG----TCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTC  87
                 |..||||  ||||.|    ..||.|| |||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   70  -----ATCTGCC--ACATTGAAAAGAACGAA-AGTCAGCGTGGGAGAAACTGTACCGAGAAACCAACAAATGTC  135

Query   88  AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACA  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  136  AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTGAGTCAGTTACA  209

Query  162  GGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTT  235
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  AGAAACATGGCTTGCTGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTTCCAGACTATCAGGCTGAAAGTT  283

Query  236  TGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGC  309
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||.|||
Sbjct  284  TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACTCGGGTCTGCTTGC  357

Query  310  AGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC  383
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  AGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC  431

Query  384  ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTC  457
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  432  ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTACACCATGCATCTC  505

Query  458  CAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGAT  531
            |||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  506  CAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCAGTCCATACCAGAC  579

Query  532  AGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGAC  605
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  580  AGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTCCTCCTTTGCCGAC  653

Query  606  GATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT  679
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  AATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT  727

Query  680  TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCC  753
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  728  TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCC  801

Query  754  CCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA  827
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA  875

Query  828  TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGT  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  876  TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGT  949

Query  902  TTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAA  975
            |.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  950  TCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGGAATGTACCGGGAA  1023

Query  976  GGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA  1049
            ||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  GGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA  1097

Query 1050  TTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTT  1123
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1098  TTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTT  1171

Query 1124  GGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAA  1197
            |||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1172  GGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTATTATTATGAGAAG  1245

Query 1198  GGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCAT  1271
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1246  GGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAGCCCTTTTCTCTAT  1319

Query 1272  GGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGC  1345
            |||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1320  GGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAAGAGGACACAGTGC  1393

Query 1346  CTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAA  1419
            ||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1394  CTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCACCCCTACAACGAA  1467

Query 1420  GGCTACGTGTAT  1431
            ||.||||||||.
Sbjct 1468  GGATACGTGTAC  1479