Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00520
• Subject: XM_006514966.3
• Aligned Length: 1492
• Identities: 1268
• Gaps: 128

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGATGGATTTTATGA  17
                                                                     .|||.|||.|||     
Sbjct    1  ATGTCCACGATGAGTGCAAGAGGAGACGGAGGGCAGCAACAGCTGCACTCAAAGTTTGTGGCTGGGTTT-----  69

Query   18  CCAGCAAGTGCCTTACATGG----TCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAAACCAACAAATGTC  87
                 |..||||  ||||.|    ..||.|| |||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   70  -----ATCTGCC--ACATTGAAAAGAACGAA-AGTCAGCGTGGGAGAAACTGTACCGAGAAACCAACAAATGTC  135

Query   88  AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTAAGTCAATTACA  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  136  AGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATCTGAGTCAGTTACA  209

Query  162  GGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTATCAGGCTGAAAGTT  235
            .||||||||||||||.||||                                                      
Sbjct  210  AGAAACATGGCTTGCTGAAG------------------------------------------------------  229

Query  236  TGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAATCAGCTCTGCCTGC  309
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||.|||
Sbjct  230  TGGCTTTTCATGGCCTCCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGCCCATGTTCAGAACTCGGGTCTGCTTGC  303

Query  310  AGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC  383
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  304  AGTCAAGAGCAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCTATGATCAGAAGCC  377

Query  384  ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTGCATCATGCATCTC  457
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  378  ACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTACACCATGCATCTC  451

Query  458  CAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCAGTCCATACCAGAT  531
            |||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  452  CAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCAGTCCATACCAGAC  525

Query  532  AGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTCCTCCTTTGCCGAC  605
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  526  AGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTCCTCCTTTGCCGAC  599

Query  606  GATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT  679
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  AATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTCCCACCACAAGGCT  673

Query  680  TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAGCCAAAGCTTTCCC  753
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  674  TTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAGCCAAAGCTTCCCC  747

Query  754  CCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA  827
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  CCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCTGCCACTCCATTTA  821

Query  828  TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAGGGCCCCAGGCAGT  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  822  TATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAGGGTCCCAGGCAGT  895

Query  902  TTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGGAATGTATCGGGAA  975
            |.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  896  TCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGGAATGTACCGGGAA  969

Query  976  GGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA  1049
            ||||||||.|||||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  GGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGGATGACCCTTCAAA  1043

Query 1050  TTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAGGTGGCCCGACGTT  1123
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1044  TTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAGGTGGCCCGGCGTT  1117

Query 1124  GGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTATTACTATGAGAAA  1197
            |||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1118  GGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTATTATTATGAGAAG  1191

Query 1198  GGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAGCCCTTTTCTCCAT  1271
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1192  GGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAGCCCTTTTCTCTAT  1265

Query 1272  GGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAGGAGGACACAGTGC  1345
            |||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1266  GGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAAGAGGACACAGTGC  1339

Query 1346  CTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCACCCCTACAACGAA  1419
            ||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1340  CTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCACCCCTACAACGAA  1413

Query 1420  GGCTACGTGTAT  1431
            ||.||||||||.
Sbjct 1414  GGATACGTGTAC  1425